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Enregistrement W4229540045 · doi:10.1615/intjmedmushr.v7.i3.160

Molecular Systematics of Ganoderma: What Is Reishi?

2005· article· en· W4229540045 sur OpenAlexaff
Jean‐Marc Moncalvo

Notice bibliographique

RevueInternational journal of medicinal mushrooms · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycorrhizal Fungi and Plant Interactions
Établissements canadiensUniversity of TorontoRoyal Ontario Museum
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGanodermaBiologyNomenclatureGenusBotanyGanoderma lucidumBasidiosporeType (biology)MushroomTaxonTaxonomy (biology)EcologySpore

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ganoderma is a very distinctive genus of white-rot polypore fungi that is primarily characterized by the formation of a double-walled, generally echinulate basidiospore. Most Ganoderma species are very variable macromorphologically and lack micromorphological distinctiveness. As a consequence, earlier taxonomic studies in the genus have created many synonymous names and have resulted in largely ambiguous species delimitation and identification systems, making species identification in the genus virtually impossible. Ganoderma strains used in oriental folk medicine refer to Reishi and have traditionally been labeled Ganoderma lucidum (W.Curt.: Fr.) P. Karst. in the scientific literature. However, there is now accumulative evidence that most species reported as G. lucidum in most of the pharmacological and phytopathological studies were wrongly identified.G. lucidum was first described as Boletus lucidus by William Curtis in 1781 from a filbert plant (= Corylus avellana) in London, UK. Curtis's original collection (i.e., the type specimen) has been lost. The actual type is represented in a color plate, which is in agreement with the International Code of Botanical Nomenclature. However, the typified plate is of no use for providing cultural characteristics and genetic information that would be useful for distinguishing G. lucidum from the other British laccate Ganoderma.Over the years, at least 166 laccate Ganoderma species have been described worldwide, of which at least 48 names were, at some point, considered to be synonyms of others. There is nevertheless a strong consensus about the true identity of G. lucidum among contemporary European mycologists. Molecular phylogenetic studies indicate that Ganoderma is a young genus in agreement with earlier morphological evidence as pointed out by the Norwegian mycologist Leif Ryvarden. DNA studies have shown that the G. lucidum species complex is composed of several species that can be difficult to distinguish from one another. These species include the European G. valesiacum Boud.; G. ahamdii Stey., described from Pakistan; North American G. tsugae Murrill and G. oregonense Murrill; and other taxa variously labeled G. resinaceum Boud., G. oerstedii Fr., and G. praelongum Murrill.Recent genetic and biogeographic studies have indicated that most Ganoderma species are geographically restricted. G. lucidum is probably restricted to western parts of Europe, although its distribution range can possibly also include parts of Siberia and of north western regions of China. Based on molecular phylogenetic evidence, it appears that most collections labeled G. lucidum in North America do in fact best correspond to the taxon labeled G. resinaceum in Europe, whereas G. tsugae in North America is genetically very close to the “true” G. lucidum from Europe.This leads to the question of what is the Oriental Reishi? A nonexhaustive molecular survey of taxa labeled G. lucidum in Asia, including strains commercially cultivated for the production of health tablets or teas, shows that this name has been largely misapplied and encompasses many distinct species.Incorrect taxonomic identification of Ganoderma strains hampers comprehensive strategies for drug discovery as well as for monitoring and managing diseases caused by Ganoderma in woody crops and forest ecosystems. Both molecular phylogenies and morphological evidence indicate that Africa probably harbors the highest genetic and taxonomic diversity in the genus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0030,004
Études des sciences et des technologies0,0010,004
Communication savante0,0030,007
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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