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Enregistrement W4232945305 · doi:10.32920/ryerson.14665104.v1

Progress Toward the Synthesis of Labeled Derivatives of the Cystic Fibrosis Drug Ivacaftor

2021· preprint· en· W4232945305 sur OpenAlexaff
Salma Elmallah

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensToronto Metropolitan University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIvacaftorCystic fibrosisPotentiatorCystic fibrosis transmembrane conductance regulatorMutationMedicinePharmacologyBioinformaticsChemistryCancer researchBiologyInternal medicineGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cystic fibrosis (CF) is one of the most common genetic diseases, affecting approximately 70,000 people worldwide causing severe complications and often leading to early death. CF is caused by a mutation in the gene encoding for the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) protein which is responsible for fluid and ion transport through epithelial membranes maintaining the formation of a thin slippery mucous layer. CFTR mutations either lead to a trafficking defect where the CFTR protein does not reach the plasma membrane or a gating defect where CFTR protein at the plasma membrane does not function properly. Treatment of cystic fibrosis usually addresses the symptoms to overcome the complications of the disease such as pneumonia, lung infections, pancreatitis, maldigestion and infertility. Vertex pharmaceuticals has been interested in developing small molecules that have the ability to interact with mutated CFTR proteins, aiding in their delivery to the cell membrane and/or restoring their channel function. VX-770 is an orally bioavailable potentiator that has the ability to improve the gating activity and increasing the open probability of CFTR protein in patients carrying the G551D mutation. VX770, Ivacaftor, was recently approved by the US FDA after showing very good improvements in the lung function in CF patients with good safety profile. Our research is focusing on the synthesis of VX770 under mild conditions and formation of labeled derivatives to help in the understanding of its exact mode of action. Different methods were developed toward the synthesis of the two main components, LHS and RHS, of VX770 by using less harsh conditions for a short period of time. We were successfully able to make two photoaffinity labeled derivatives, aryl azide and benzophenone derivatives, which will be beneficial in tracking the drug molecule and revealing the exact site of interaction between the drug and the protein. Synthesis of VX770 fragments was is another focus of interest in our research as they will provide us with information about the best positions for further derivatization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
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Résumé présentoui

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