Autoactivation of the AggR regulator of enteroaggregative<i>Escherichia coli in vitro</i>and<i>in vivo</i>
Notice bibliographique
Résumé
Enteroaggregative Escherichia coli (EAEC) causes diarrhea in diverse populations worldwide. The AraC-like regulator AggR is a key virulence regulator in EAEC. AggR-regulated genes include those encoding the Aggregative Adherence Fimbria, the dispersin protein, and a type VI secretion system. This study characterizes the regulation of the aggR promoter (PaggR). Using primer extension analysis, the transcriptional start site of the aggR promoter was located 40 nucleotides upstream of the translational start. PaggR was found to be autoregulated and DNA footprinting revealed the presence of two AggR-binding sites: one upstream of the transcriptional start site and one downstream. Additionally, PaggR was found to be positively regulated by the DNA-binding protein FIS and negatively regulated by the global regulator H-NS. To further understand this complex regulation scheme, a bacterial luciferase reporter system was used with a mouse model of EAEC colonization. This allowed for the in vivo measurement of PaggR, Pfis, and Phns activity. EAEC present in the mouse intestine possessed relatively high levels of Pfis and PaggR activity and a low level of Phns when compared with in vitro experiments. The data provide significant insights into the regulation cascade leading to aggR expression in the mammalian intestine during EAEC infection.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,002 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».