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Enregistrement W423413564 · doi:10.1016/b978-1-60805-963-8.50003-2

Theory and Applications of NMR-Based Metabolomics in Human Disease Diagnosis

2015· book-chapter· en· W423413564 sur OpenAlexaff
Abdul‐Hamid Emwas, Jasmeen S. Merzaban, Haçène Serrai

Notice bibliographique

RevueGhent University Academic Bibliography (Ghent University) · 2015
Typebook-chapter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesKing Abdullah University of Science and Technology
Mots-clésMetabolomicsHuman diseaseDiseaseComputational biologyProteomicsBiologyBioinformaticsMedicinePathologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Metabolomics is a dynamic and emerging research field, joining proteomics, transcriptomics and genomics in affording a comprehensive understanding of biological systems and how these systems are affected by environmental stimuli and/or genetic modification. Metabolomics is particularly helpful for identifying biomarkers of disease processes such as the effects of a high fat diet on cardiovascular disease, providing insight into the interaction between genes and diet. Nuclear Magnetic Resonance (NMR) and Mass spectrometry (MS) are the most common analytical tools in metabolomics research. The high reproducibility of NMR-based techniques makes it superior to other analytical techniques especially in terms of searching for new and novel biomarkers in human diseases. Recently, NMR-based metabolomics approaches have been proposed as a promising and powerful technique for diagnosis of several human diseases. They have been used to investigate a wide range of diseases, through the examination of different kinds of human samples, including urine, blood plasma/serum, blister fluid, saliva, as well as intact tissue biopsies and tissue extracts. However, several factors can influence the metabolic balance within the human body and therefore in samples drawn from the body, including gender, age, fasting, diet, emotional stress, drug administration, physical activity and life style, thus complicating the use of NMR-based metabolomics approaches in diagnosing specific human disease. This chapter highlights the potential applications of NMR-based metabolomics approaches as a promising technique for diagnosis of human diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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