Alterations in the proteome of the NHERF1 knockout mouse jejunal brush border membrane vesicles
Notice bibliographique
Résumé
Na/H exchanger regulatory factor 1 (NHERF1) is a scaffold protein made up of two PDZ domains and an ERM binding domain. It is in the brush border of multiple epithelial cells where it modulates 1) Na absorption by regulating NHE3 complexes and cytoskeletal association, 2) Cl secretion through trafficking of CFTR, and 3) Na-coupled phosphate absorption through membrane retention of NaPi2a. To further understand the role of NHERF1 in regulation of small intestinal Na absorptive cell function, with emphasis on apical membrane transport regulation, quantitative proteomic analysis was performed on brush border membrane vesicles (BBMV) prepared from wild-type (WT) and homozygous NHERF1 knockout mouse jejunal villus Na absorptive cells. Jejunal architecture appeared normal in NHERF1 null; however, there was increased proliferative activity, as indicated by increased crypt BrdU staining. LC-MS/MS analysis using iTRAQ to compare WT and NHERF1 null BBMV identified 463 proteins present in both WT and NHERF1 null BBMV of simultaneously prepared and studied samples. Seventeen proteins had an altered amount of expression between WT and NHERF1 null in two or more separate preparations, and 149 total proteins were altered in at least one BBMV preparation. The classes of the majority of proteins altered included transport proteins, signaling and trafficking proteins, and proteins involved in proliferation and cell division. Affected proteins also included tight junction and adherens junction proteins, cytoskeletal proteins, as well as metabolic and BB digestive enzymes. Changes in abundance of several proteins were confirmed by immunoblotting [increased CEACAM1, decreased ezrin (p-ezrin), NHERF3, PLCβ3, E-cadherin, p120, β-catenin]. The changes in the jejunal BBMV proteome of NHERF1 null mice are consistent with a more complex role of NHERF1 than just forming signaling complexes and anchoring proteins to the apical membrane and include at least alterations in proteins involved in transport, signaling, and proliferation.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».