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Enregistrement W4234560967 · doi:10.1093/ibd/izy038.007

P176 COMPLICATED CROHN’S DISEASE IS ASSOCIATED WITH PERIANAL INVOLVEMENT, IBD-ASSOCIATED SEROLOGIES, AND POLYGENIC RISK SCORES DERIVED FROM IBD-ASSOCIATED VARIANTS

2018· article· en· W4234560967 sur OpenAlexaboutno aff
Shishir Dube, Phillip Gu, Talin Haritunians, Dalin Li, Dermot McGovern

Notice bibliographique

RevueInflammatory Bowel Diseases · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutoimmune Bullous Skin Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineInflammatory bowel diseaseCrohn's diseasePolygenic risk scoreDiseaseInternal medicineBiologyGeneticsGeneSingle-nucleotide polymorphismGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In Crohn’s disease (CD), disease severity is categorized by the Montreal classification. More complicated (stricturing and/or penetrating) disease is associated with poor quality of life. Our aim was to identify clinical, serological, and genetic factors associated with complicated CD. For each disease location, we performed case-control univariate analyses comparing stricturing (B2), stricturing and penetrating (B2/B3), or penetrating (B3) to non-stricturing/non-penetrating (B1) CD. Demographics and clinical features were obtained by chart review. ELISA was used to determine IBD-related serologies. Genotyping was performed using Illumina Immunochip array. Polygenic risk scores (PRS) were calculated using known IBD-associated variants weighted for effect sizes. We included 1919 caucasian CD patients from a single center. Summary statistics for disease phenotype by disease location can be seen in Table 1. In small bowel (L1), colonic (L2), and ileocolonic (L3) disease, all three complicated disease phenotypes (B2, B2/B3, and B3) were associated with positive serology for ASCA IgA (OR 2.09–5.62, adj p < 2.84e-6). B2 (in L2 and L3) was associated with perianal involvement (OR 1.74–4.14, adj p < 0.01413). More complicated disease phenotype was associated with PRS for CD (OR 1.24–2.15, adj p < 0.0423) and B1 phenotype was associated with PRS for UC (Ulcerative Colitis) (OR 0.477–0.82, adj p < 0.0386). We have identified association of perianal involvement, ASCA IgA, and CD PRS to complicated disease behavior. In addition, we discovered a UC PRS association with B1 phenotype even in colonic disease. These findings can help identify patients at risk of developing more severe disease and help individualize management decisions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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