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Enregistrement W4235282642 · doi:10.21203/rs.3.rs-40780/v2

Decoding semi-automated title-abstract screening: a retrospective exploration of the review, study, and publication characteristics associated with accurate relevance predictions

2020· preprint· en· W4235282642 sur OpenAlexaff
Allison Gates, Michelle Gates, Daniel DaRosa, Sarah A. Elliott, Jennifer Pillay, Sholeh Rahman, Ben Vandermeer, Lisa Hartling

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiomedical Text Mining and Ontologies
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRelevance (law)Decoding methodsInformation retrievalComputer scienceData scienceAlgorithmPolitical science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background. We evaluated the benefits and risks of using the Abstrackr machine learning (ML) tool to semi-automate title-abstract screening, and explored whether Abstrackr’s predictions varied by review or study-level characteristics. Methods. For a convenient sample of 16 reviews for which adequate data were available to address our objectives (11 systematic reviews and 5 rapid reviews) we screened a 200-record training set in Abstrackr and downloaded the relevance (relevant or irrelevant) of the remaining records, as predicted by the tool. We retrospectively simulated the liberal-accelerated screening approach. We estimated the time savings and proportion missed compared with dual independent screening. For reviews with pairwise meta-analyses, we evaluated changes to the pooled effects after removing the missed studies. We explored whether the tool’s predictions varied by review and study-level. Results. Using the ML-assisted liberal-accelerated approach, we wrongly excluded 0 to 3 (0 to 14%) records that were included in the final reports, but saved a median (IQR) 26 (9, 42) hours of screening time. One missed study was included in eight pairwise meta-analyses in one systematic review. The pooled effect for just one of those meta-analyses changed considerably (from MD (95% CI) -1.53 (-2.92, -0.15) to -1.17 (-2.70, 0.36)). Of 802 records in the final reports, 87% were correctly predicted as relevant. The correctness of the predictions did not differ by review (systematic or rapid, P=0.37) or intervention type (simple or complex, P=0.47). The predictions were more often correct in reviews with multiple (89%) vs. single (83%) research questions (P=0.01), or that included only trials (95%) vs. multiple designs (86%) (P=0.003). At the study level, trials (91%), mixed methods (100%), and qualitative (93%) studies were more often correctly predicted as relevant compared with observational studies (79%) or reviews (83%) (P=0.0006). Studies at high or unclear (88%) vs. low risk of bias (80%) (P=0.039), and those published more recently (mean (SD) 2008 (7) vs. 2006 (10), P=0.02) were more often correctly predicted as relevant. Conclusion. Our screening approach saved time and may be suitable in conditions where the limited risk of missing relevant records is acceptable. As several of our findings are paradoxical, and require further study to fully understand the tasks to which ML-assisted screening is best suited.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,673
Score d'incertitude au seuil0,559

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,107
Tête enseignante GPT0,399
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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