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Enregistrement W4235442504 · doi:10.1158/1538-7445.sabcs18-ct129

Abstract CT129: Identifying molecular determinants of response to apalutamide (APA) in patients (pts) with nonmetastatic castration-resistant prostate cancer (nmCRPC) in the SPARTAN study

2019· article· en· W4235442504 sur OpenAlexaff
Felix Y. Feng, Shibu Thomas, Michael Gormley, Angela Lopez‐Gitlitz, Margaret K. Yu, Shinta Cheng, Deborah Ricci, Brendan Rooney, Paul N. Mainwaring, David Olmos, Fred Saad, Simon Chowdhury, Boris Hadaschik, Nick Fishbane, Elai Davicioni, Yang Liu, Eric J. Small, Matthew R. Smith

Notice bibliographique

RevueClinical Trials · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Treatment and Research
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProstate cancerMedicineInternal medicineOncologyMetastasisTranscriptomeCancerAndrogen receptorBiologyGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: The SPARTAN study recently demonstrated that the addition of APA to androgen deprivation therapy (ADT) improved metastasis-free survival (MFS) and second progression-free survival (PFS2) in pts with nmCRPC defined by conventional imaging. We performed transcriptome-wide profiling of available primary tumor samples from pts in SPARTAN to evaluate predictors of response or resistance to APA + ADT.Methods: We used a commercially available genomic assay (DECIPHER® prostate test, GenomeDx, San Diego, CA) to assess gene expression in archived primary tumors from SPARTAN pts. DECIPHER GC, a 22-marker mRNA-based genomic classifier (GC), was validated for predicting metastatic prostate cancer (Karnes RJ, et al. J Urol. 2013), and basal/luminal (BA/LU) subtyping was validated in prostate cancer (Zhao SG, et al. JAMA Oncol. 2017; Zhang D, et al. Nat Commun. 2016). Pts were stratified into high and low risk for developing metastases based on DECIPHER GC score high (GC > 0.6) and low to average (GC ≤ 0.6), respectively, and into BA and LU subtypes. Gene signatures representing key biological pathways associated with the BA subtype were also assessed. We analyzed the association between GC scores and subtypes and outcomes using a Cox proportional hazards model.Results: A total of 233 pts were assessed; 117 pts had high GC score. Pts with both high and low to average GC score had improved outcomes with APA + ADT vs ADT alone. Pts with poor-prognosis high GC score had improved MFS (HR = 0.21, p < 0.0001) and PFS2 (HR = 0.26, p = 0.0084) with APA + ADT vs ADT, suggesting APA overcomes the negative prognosis in these pts. Approximately 65% of pts (n = 151) had the BA subtype associated with poor prognosis, indicating the high-risk nature of nmCRPC with short PSA doubling time. Key biological pathways associated with the BA subtype in nmCRPC were neuroendocrine differentiation, epithelial-mesenchymal transition, angiogenesis, and inflammation. Pts with the LU subtype, known to be sensitive to ADT, and with the BA subtype, typically resistant to ADT, benefited from APA + ADT vs ADT alone: HR for MFS = 0.22 and 0.34, p = 0.0017 and 0.0001, for LU and BA, respectively. Similar benefit was observed for PFS2. Both LU and BA pts had similar MFS benefit with ADT. LU pts had greater benefit from APA + ADT than BA pts: HR for MFS in LU vs BA subtypes was 0.40, p = 0.0295.Conclusions: Molecular signatures derived from primary tumors, such as DECIPHER GC and BA/LU subtypes, stratify pts with nmCRPC who would benefit from APA + ADT despite the high risk for progression. DECIPHER GC may be useful for identifying pts for early treatment intensification with APA or other agents, and BA/LU subtyping may be an effective approach for pt selection in trials combining novel therapies with APA.Citation Format: Felix Feng, Shibu Thomas, Michael Gormley, Angela Lopez-Gitlitz, Margaret K. Yu, Shinta Cheng, Deborah S. Ricci, Brendan Rooney, Paul N. Mainwaring, David Olmos, Fred Saad, Simon Chowdhury, Boris Hadaschik, Nick Fishbane, Elai Davicioni, Yang Liu, Eric J. Small, Matthew R. Smith. Identifying molecular determinants of response to apalutamide (APA) in patients (pts) with nonmetastatic castration-resistant prostate cancer (nmCRPC) in the SPARTAN study [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2019; 2019 Mar 29-Apr 3; Atlanta, GA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2019;79(13 Suppl):Abstract nr CT129.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Étiquettes directes de modèles (non validées)

Étiquettes de catégorie et de devis d'étude par modèle, issues des rondes d'étiquetage. C'est une sortie machine, non validée, et le désaccord entre modèles est livré comme donnée. Aucun devis ici n'est encore validé contre MEDLINE.

BrasCatégoriesDevis d'étudeConfiance
gemmaaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Observationnellow
gptaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Autre devislow
modèles en désaccordL'accord compare des ensembles de catégories et des devis identiques entre les bras.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,014
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil0,470

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0140,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,217
Tête enseignante GPT0,522
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Étiqueté directement par 2 modèles lisant le dossier complet.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.

Les modèles divergent sur des parties de cette classification; chaque voix est préservée dans la section en fin de page.

Devis d'étudeObservationnel · Autre devis
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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