P.053 Whole-genome sequencing identified a frameshift mutation at LMNB1 in a family with early-onset dystonia
Notice bibliographique
Résumé
Background: Dystonia is a hyperkinetic condition that produces abnormal movements or postures. Its diagnostic procedure is often challenging and time consuming. Genetic testing provides an effective approach for diagnosis, but currently only very few dystonia genes have been identified. We propose that studying early-onset forms of dystonia with the use of whole-genome sequencing (WGS) will improve the identification of dystonia-relevant genes and mutations. Methods: We performed deep WGS using the Illumina HiSeq X technology in a mother-proband pair with dystonia. The mother has generalized dystonia (age of onset: 15) and the proband has myoclonic dystonia (age of onset: 11). Results: No pathogenic mutation was identified in any of the known dystonia genes. However, we identified a rare heterozygous frameshift mutation (p.K342fs*7) at LMNB1 that was shared between the mother and the proband. Duplication of LMNB1 is known to cause Adult-onset Demyelinating Leukodystrophy. A heterozygous deletion of LMNB1 has been reported in a patient with microcephaly and global developmental disorder. Conclusions: Further characterization of phenotypes in the participants and their family members is needed to confirm the relationship between mutation in LMNB1 and dystonia. This work provides a proof-of-principle that novel disease-relevant genes can potentially be identified using the proposed approach.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,008 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».