Abstracts, British Columbia Regional Meeting, The Canadian Phytopathological Society, 1999
Notice bibliographique
Résumé
Several dominant avirulence genes from the smut fungus, Ustilago hordei, have been identified on differential cultivars of barley.We analyzed 50 progeny segregating for three unlinked Avr genes, VI, V2, and V6.Two RAPD markers, loosely linked to VI at 7 and 2 map units, have been found by bulk segregant analysis.One AFLP marker, linked to the recessive allele vl, was found physically closer but still at 2 cM distance.A cosmid carrying this AFLP marker harbored a nearby probe, common to both parents, that could not detect recombinants.The area is embedded in a repetitive, difficult-to-clone DNA region.A BAC-library representing the avirulent parent yielded several overlapping clones.Genomic walking identified probes that, upon recombinational analysis, delimited VI on an approximately 40-kb region.Pathogenicity tests with subclones are underway.Only germinating seedlings can be inoculated with mated strains and success rates during compatible interactions vary from several to 80%.Reliable scoring is possible only at heading after 8 weeks.The incompatible interaction does not show any visible, macroscopic symptoms such as lesions or HR.We have also found through phylogenetic analysis of ITS sequences and AFLP fingerprint comparisons, that the small grain-infecting smuts which include U. hordei, consist of a closely related group of organisms pathogenic on related hosts. Molecular characterization of DNA encoding 16S-23S rRNA intergenic spacer regions and 16S rRNA of pectolytic Erwinia species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,497 | 0,240 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».