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Enregistrement W4237835182 · doi:10.1093/neuonc/now212.640

PDTB-21. CD271 (p75NTR) AS A NOVEL DIAGNOSTIC MARKER AND THERAPEUTIC TARGET FOR SHH MEDULLOBLASTOMA

2016· article· en· W4237835182 sur OpenAlexaff
Lisa Liang, Ludivine Coudiere-Morrision, Nazanin Tatari, Marc Remke, Vijay Ramaswamy, Magimairajan Issaivanan, Timothy C. Ryken, Marc R. Del Bigio, Michael D. Taylor, Tamra E. Werbowetski‐Ogilvie

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Degradation and Inhibitors
Établissements canadiensCancerCare ManitobaHospital for Sick ChildrenSickKids FoundationUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedulloblastomaCancer researchGene knockdownFlow cytometryImmunohistochemistryLow-affinity nerve growth factor receptorWnt signaling pathwayProgenitor cellBiologySonic hedgehogPhenotypeStem cellCell cultureMolecular biologyCell biologyImmunologySignal transductionGeneReceptorGeneticsNeurotrophin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Medulloblastoma (MB) is the most common malignant primary brain tumor in children. Despite improved clinical outcomes, children with MB often suffer from consequences of treatment such as surgery, chemotherapy and radiation. MB is currently classified into 4 distinct molecular subtypes based on genomic alterations, gene expression profiles, response to treatment and cell of origin; WNT, SHH, Group 3, and Group 4. This extensive heterogeneity has revealed a critical need for subtype-specific, functionally validated biomarkers and therapeutic strategies. Using an unbiased high throughput flow cytometry screen, we identified CD271/p75NTR as a candidate SHH stem/progenitor cell marker. Here, we explored the functional role of CD271 in SHH MB cell lines and primary cultures, using gain/loss of function studies and treatments with a CD271 inhibitor, γ-secretase inhibitor (GSI). This was followed by cellular assays to measure sphere-forming capacity, self-renewal, proliferation and differentiation. Immunohistochemical (IHC) staining for CD271 was also conducted in formalin fixed paraffin embedded (FFPE) patient samples to assess expression of CD271 across MB subtypes. CD271 levels were high in SHH MB samples with minimal to no staining in WNT, Group 3, and Group 4 MBs. Stable overexpression of CD271 resulted in increased tumorsphere size, whereas CD271 knockdown cells exhibited a reversal of this cellular phenotype. Similarly, treatment of UI226 SHH MB primary cells with GSI also resulted in a significant decrease in tumorsphere growth and self-renewal, providing an opportunity to exploit CD271 as a therapeutic target. As CD271 appears to be specific to SHH MB, this marker may serve as a potential diagnostic tool. Further characterization of CD271 signaling in SHH MB could ultimately lead to development of targeted therapies that will lessen the broad impact of current toxic treatments, and improve the quality of life for children who survive long- term.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
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Résumé présentoui

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