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Enregistrement W4238389391 · doi:10.1021/jp108343g

Effect of Point Mutations on the Secondary Structure and Membrane Interaction of Antimicrobial Peptide Anoplin

2011· article· en· W4238389391 sur OpenAlexaff
Amy Won, Stahs Pripotnev, Annamaria Ruscito, Anatoli Ianoul

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry B · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntimicrobial Peptides and Activities
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryPeptideMembraneMonolayerAntimicrobial peptidesMicelleLipid bilayerVesicleProtein secondary structureBiophysicsAqueous solutionCrystallographyStereochemistryBiochemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Anoplin (GLLKRIKTLL-NH 2 ) is the smallest linear α-helical antimicrobial peptide found naturally to date. Antibacterial and hemolytic properties of anoplin depend strongly on physicochemical properties. Two anoplin derivatives, anoplin-8K (Ano8K, GLLKTIKKLL-NH 2 ) and anoplin-1K5 V8K (Ano1K5 V8K, KLLKVIKLL-NH 2 ), were found to have increased bacterial and low hemolytic activity. In the present work physicochemical properties of these three peptides were studied by UV resonance Raman (UVRR) spectroscopy, Langmuir−Blodgett monolayer technique, and carboxyfluorescein (CF) leakage assay. UVRR data indicated that all three peptides adopt predominantly unordered conformation in aqueous buffer solution. In membrane-mimicking trifluoroethanol, the α-helical content increases for all three peptides with Ano1K5 V8K having the highest α-helix percentage, followed by Ano8K and anoplin. Critical micelle concentrations were found to be similar for all three peptides, and the saturation pressure decreases in the sequence Ano1K5 V8K, anoplin, Ano8K. Critical pressure of insertion was found to be greater for anionic lipid monolayer DPPG than for zwitterionic lipid DPPC indicating preferential adsorption of all three peptides to DPPG. Finally, membrane lytic activities of all three peptides toward various model lipid vesicles were compared through CF leakage assay. Overall the data indicate that antimicrobial activity of anoplin increases with charge, whereas membrane lytic activity correlates with peptides helicity and amphipathicity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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