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Enregistrement W4238792430 · doi:10.1002/9781118960608.gbm00887

<i>Roseococcus</i>

2015· other· en· W4238792430 sur OpenAlexaff
Vladimir V. Yurkov

Notice bibliographique

RevueBergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria · 2015
Typeother
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial Metabolism and Applications
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAlphaproteobacteriaBacteriochlorophyllBiologyBotanyPigmentPhototrophThiosulfateProteobacteriaBacteriaChemistryPhotosynthesis16S ribosomal RNAGeneticsSulfurOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Ro'se.o.coc'cus. M.L. adj. roseus rose, pink; Gr. n. coccus sphere or spheroidal shape; M.L. masc. n. Roseococcus pink spherical bacterium. Cells are Gram negative , coccoidal , pink and motile by means of polar flagella. Divide by binary fission. Bacteriochlorophyll a and carotenoid pigments are present. Obligately aerobic , chemoorganotrophic (respiratory metabolism) and facultatively photoheterotrophic . No growth occurs under anaerobic conditions in the light . May use thiosulfate as an additional energy source. Methanol is not utilized. NaCl not required for growth. The mol % G + C of the DNA is : 70.4. Type species : Roseococcus thiosulfatophilus Yurkov, Stackebrandt, Holmes, Fuerst, Hugenholtz, Golecki, Gad' on, Gorlenko, Kompantseva and Drews 1994c, 432. Taxonomic and Nomenclature Notes According to the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), the taxonomic status of the genus Roseococcus is: correct name (last update, February 2025) * . LPSN classification: Bacteria / Pseudomonadati / Pseudomonadota / Alphaproteobacteria / Rhodospirillales / Acetobacteraceae / Roseococcus The genus Roseococcus can also be recovered in the Genome Taxonomy Database (GTDB) as g__Roseococcus (version v220) ** . GTDB classification: d__Bacteria / p__Pseudomonadota / c__Alphaproteobacteria / o__Acetobacterales / f__Acetobacteraceae / g__Roseococcus * Meier‐Kolthoff et al. ( 2022 ). Nucleic Acids Res , 50 , D801 – D807 ; DOI: 10.1093/nar/gkab902 ** Parks et al. ( 2022 ). Nucleic Acids Res , 50 , D785 – D794 ; DOI: 10.1093/nar/gkab776

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: Autre
Score de désaccord entre enseignants0,030
Score d'incertitude au seuil0,100

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0300,034

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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