C-terminal domain of nonhistone protein HMGB1 as a modulator of HMGB1–DNA structural interactions
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Notice bibliographique
Résumé
The HMGB1 protein (High Mobility Group protein 1) participates in the formation of functionally significant DNA-protein complexes. HMGB1 protein contains two DNA-binding domains and negatively charged C-terminal region. The latter consists of continuous sequence of dicarboxylic amino acids residues. Structural changes in DNA-protein complexes were studied by circular dichroism spectroscopy (CD) and atomic force microscopy (AFM). Natural HMGB1 and recombinant protein HMGB1(A + B) lacked negatively charged C-terminal region were used. The DNA–HMGB1(A + B) complexes demonstrate an unusually high optical activity in 150 mM NaCl solutions. AFM of the latter complexes shows, that at the low concentration of HMGB1 in the complex the protein is distributed along DNA in a random way. Increase of HMGB1 content leads to cooperative interaction and a redistribution of the bound protein molecules on DNA is observed. Based on the data obtained we conclude that protein–protein interactions play a key role in the formation of highly ordered DNA–HMGB1 complexes. It was shown that C-terminal domain modulate the interactions of DNA with HMGB1 protein. We suggest that the C-terminal domain of HMGB1 also modulates the “packing” of HMGB1 molecules on the DNA.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle