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Enregistrement W4240563299 · doi:10.1002/9780470015902.a0000386.pub3

Archaellum

2020· other· en· W4240563299 sur OpenAlexaff
Ken F. Jarrell, Patrick Tripp, Sonja‐Verena Albers

Notice bibliographique

RevueEncyclopedia of Life Sciences · 2020
Typeother
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtist diversity and phylogeny
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPilusFlagellumArchaeaBiologyCiliumBacteriaCrosstalkCell biologyOperonMotilityGeneticsEvolutionary biologyComputational biologyGeneEscherichia coli

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Each of the three domains of life contains its own unique swimming apparatus. The archaellum (formerly called archaeal flagellum) is a unique, ‘tail‐like’ structure used for motility by single‐celled organisms belonging to the domain Archaea. Although archaella are functionally similar to the flagella found on bacteria, they differ significantly in structure and mode of assembly. Archaella are evolutionarily related to type IV pili, and each of the two systems shares several key homologues required for assembly of the respective structures. Recent studies have contributed much to our knowledge concerning the regulation of the operon encoding the archaellum proteins. In addition, the elucidation of the structures of most of the Fla proteins involved in archaella structure and function, coupled with detailed atomic models of the archaellum, including the motor, has provided major insights into how this unique motility organelle is assembled and functions, often in harsh environments inhabited by many archaea. Key Concepts Each of the three domains of life has a unique motility apparatus, which have recently been assigned distinct names (Archaea: archaellum; Bacteria: flagellum and Eukaryotes: cilium). The archaellum is functionally equivalent to flagellum but is evolutionarily related to a type IV pilus, with the archaella and type IV pili systems sharing important homologues. Archaea have the ability to regulate the synthesis of archaella depending on growth conditions, such as available nutrients and temperature. There can be crosstalk in the regulation of archaella with adhesive pili, allowing the cells under certain conditions to make only one type of appendage, either for swimming or adhesion. N‐Glycosylation of the major filament proteins, the archaellins, is widespread and essential under normal conditions for assembly of filaments. The ATPase responsible for assembly of the archaellins into the filament, that is, FlaI, is also responsible for the hydrolysis of ATP that powers the rotation of archaella. In many archaea, the archaellum interacts with a bacterial‐like chemotaxis system that requires novel chemotaxis proteins to act as adaptors to connect the systems. Not all archaellated species have an associated chemotaxis system. Knowledge of the structure and assembly of archaella has greatly increased in the past 5 years with atomic models of several archaella structures as well as structures of most of the individual archaella proteins and their interaction partners.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: Autre
Score de désaccord entre enseignants0,036
Score d'incertitude au seuil0,000

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,003
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0360,044

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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