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Secretion of cytoplasmic and nuclear proteins from animal cells using novel secretion modules

2000· article· en· W4240821788 sur OpenAlexaff
Paul J. Farrell, Leo A. Behie, Kostas Iatrou

Notice bibliographique

RevueProteins Structure Function and Bioinformatics · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInsect Resistance and Genetics
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSecretionSignal peptideBiologyBiochemistrySecretory proteinFusion proteinExtracellularRecombinant DNACytoplasmProteaseMolecular biologyCell biologyEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Production of recombinant proteins that are not secreted outside the producing cells usually requires purification steps that can result in significant yield reductions and loss of biological activity. Using insect cells as a model system to devise the means for secreting recombinant proteins that are not normally destined for secretion outside the producing cells, we initially examined the ability of an insect-specific signal peptide sequence to direct secretion of two intracellular proteins (the cytoplasmic enzyme chloramphenicol acetyl transferase [CAT] and the nuclear protein Bombyx mori chorion factor 1 [BmCF1]) expressed in transfected silkmoth cells. Although this signal sequence functioned efficiently as a chimera with normally secreted proteins, it failed to secrete CAT and BmCF1, suggesting that additional signals are required for passage of these polypeptides through the secretion pathway. For this reason, we also generated a secretion module consisting of the secreted protein juvenile hormone esterase (JHE), a spacer region containing a histidine tag and an endopeptidase cleavage site, to which coding sequences of choice can be cloned as C-terminal extensions. In C-terminal fusions with the CAT and BmCF1 open reading frames, the N-terminal JHE moiety was able to provide all the signals necessary for secretion of CAT and BmCF1 into the extracellular environment. The histidine tag present in the spacer region allowed purification of fusion proteins by metal affinity chromatography under nondenaturing conditions, and the enteropeptidase cleavage site was recognized and cleaved by the cognate protease causing the release of the intracellular proteins from the secretion module. We also show that another secreted protein, human granulocyte-macrophage colony stimulating factor (GM-CSF) can substitute for JHE in the secretion module and that these secretion modules can function in mammalian cells. Proteins 2000;41:144–153. © 2000 Wiley-Liss, Inc.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,101
Score d'incertitude au seuil0,648

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,192
Écart entre enseignants0,186 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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