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Enregistrement W4241012665 · doi:10.1002/9781118960608.fbm00164.pub2

<i> <scp>B</scp> eijerinckiaceae </i>

2016· other· en· W4241012665 sur OpenAlexaff
Svetlana N. Dedysh, Peter F. Dunfield

Notice bibliographique

RevueBergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria · 2016
Typeother
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAlphaproteobacteriaBiologyProteobacteriaFacultativeActinobacteriaType genusBacteriaMicrobiologyBotanyGenusType speciesGenetics16S ribosomal RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Beij.e.rinck.i.a.ce'ae. N.L. fem. n. Beijerinckia type genus of the family; ‐ aceae ending to denote family; N.L. fem. pl. n. Beijerinckiaceae the Beijerinckia family. The family Beijerinckiaceae accommodates Gram‐negative, aerobic, non‐spore‐forming, moderately acidophilic bacteria, which divide by binary or irregular fission. Most family members produce polysaccharide capsules, form poly‐β‐hydroxybutyrate granules, and are capable of fixing dinitrogen. They are mesophilic and psychrotolerant bacteria. The major fatty acid is C 18:1 ω7 c . Members of this family display extremely versatile metabolic types including chemoheterotrophs, facultative methylotrophs, facultative and obligate methanotrophs, and anoxygenic phototrophs. All genera in this family include representatives with C1 metabolic capabilities. Habitats are acidic wetlands and soils. DNA G + C content (mol%) : 54.7–65.3. Type genus : Beijerinckia Derx 1950, 145 AL . Taxonomic and Nomenclature Notes According to the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), the taxonomic status of the family Beijerinckiaceae is: correct name (last update, April 2026) * . LPSN classification: Bacteria / Pseudomonadati / Pseudomonadota / Alphaproteobacteria / Hyphomicrobiales / Beijerinckiaceae The family Beijerinckiaceae can also be recovered in the Genome Taxonomy Database (GTDB) as f__Beijerinckiaceae (version v232) ** . GTDB classification: d__Bacteria / p__Pseudomonadota / c__Alphaproteobacteria / o__Rhizobiales / f__Beijerinckiaceae * Freese , H.M. , Meier‐Kolthoff , J.P. , Sardà Carbasse , J. , Afolayan , A.O. , Göker , M. ( 2026 ). TYGS and LPSN in 2025: a Global Core Biodata Resource for genome‐based classification and nomenclature of prokaryotes within DSMZ Digital Diversity. Nucleic Acids Res , 54 (), D884 – D891 ; doi: 10.1093/nar/gkaf1110 ** Parks , D.H. , Chaumeil , P.‐A. , Mussig , A.J. , Rinke

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,091
Score d'incertitude au seuil0,303

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0910,032

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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