Faculty Opinions recommendation of Optimizing Nervous System-Specific Gene Targeting with Cre Driver Lines: Prevalence of Germline Recombination and Influencing Factors.
Notice bibliographique
Résumé
The Cre-loxP system is invaluable for spatial and temporal control of gene knockout, knockin, and reporter expression in the mouse nervous system.However, we report varying probabilities of unexpected germline recombination in distinct Cre driver lines designed for nervous systemspecific recombination.Selective maternal or paternal germline recombination is showcased with sample Cre lines.Collated data reveal germline recombination in over half of 64 commonly used Cre driver lines, in most cases with a parental sex bias related to Cre expression in sperm or oocytes.Slight differences among Cre driver lines utilizing common transcriptional control elements affect germline recombination rates.Specific target loci demonstrated differential recombination; thus, reporters are not reliable proxies for another locus of interest.Similar principles apply to other recombinase systems and other genetically targeted organisms.We hereby draw attention to the prevalence of germline recombination and provide guidelines to inform future research for the neuroscience and broader molecular genetics communities. In BriefLuo et al. report variable rates of germline recombination in commonly used mouse Cre driver lines, influenced by sex of Cre-carrying parents and target loci.Guidelines are provided to optimize cell-type-specific recombination in genetically targeted organisms expressing sitespecific recombinases.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,029 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,008 | 0,014 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,004 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,146 | 0,124 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».