MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4243499030 · doi:10.4236/health.2018.108081

Crystal Structures of Human 17<i>β</i>-Hydroxysteroid Dehydrogenase Type 1 Complexed with the Dual-Site Inhibitor EM-139

2018· article· en· W4243499030 sur OpenAlexaff
Tang Li, Dao‐Wei Zhu, Fernand Labrie, Sheng‐Xiang Lin

Notice bibliographique

RevueHealth · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEstrogen and related hormone effects
Établissements canadiensTheratechnologies (Canada)Université Laval
Organismes subventionnairesArgonne National Laboratory
Mots-clésHydroxysteroid dehydrogenaseMoietyChemistryStereochemistryEnzymeDehydrogenaseEstroneHydrogen bondBinding siteMoleculeBiochemistryHormone

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human 17β-hydroxysteroid dehydrogenase type 1 (17β-HSD1) catalyzes the biosynthesis of the most potent natural estrogen 17β-estradiol (E2) from estrone (E1) in the ovary and peripheral tissues, playing a pivotal role in the progression of estrogen-dependent diseases. N-n-Butyl-N-methyl-ll-(16'α-chloro-3',17'β-dihydroxyestra-1',3',5'(10')-trien-7'α-yl)undecanamide (EM-139) was previously described as a dual-site inhibitor that can inhibit 17β-HSD1 transforming E1 into E2 and also inhibit estrogen receptor. In the present report, we describe the co-crystallization of EM-139 with 17β-HSD1 as well as the analysis of the three-dimensional structure of the enzyme/inhibitor complex. The crystal is grown under similar condition as native crystals, whereas the space group is changed to I121 never observed in other 17β-HSD1 crystals before. The steroidal moiety of the bound EM-139 molecule has shown a binding pattern similar to E2 in the E2 binary complex. The O-3 of the inhibitor develops hydrogen bonds with residues His221 and Glu282, whereas the O-17 makes hydrogen bonds with Ser142 and Tyr155. The bulky 7α-alkyl moiety of the inhibitor, which is essential for its anti-estrogenic activity but cannot be defined in the electron density, may compromise the inhibitory effect of EM-139 to 17β-HSD1. Moreover, the 16α-Cl atom shows no obvious interaction with surrounding residues. The atomic level understanding of the inhibitory mechanism of EM-139 provides important information for the inhibitor design of 17β-HSD1, which will facilitate future development of more potent and selective inhibitors of the enzyme for therapeutic purposes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,658
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueHealthMême sujetEstrogen and related hormone effectsTravaux en français237 207