Epigenetic Regulation of <i>NAMPT</i> by <i>NAMPT-AS</i> Drives Metastatic Progression in Triple-Negative Breast Cancer
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Triple-negative breast cancer (TNBC) is highly heterogeneous and has a poor prognosis. It is therefore important to identify the underlying molecular mechanisms in order to develop novel therapeutic strategies. Although emerging research has revealed long noncoding RNAs (lncRNA) as vital to carcinogenesis and cancer progression, their functional involvement in TNBC has not been well defined. In this study, we utilized the The Cancer Genome Atlas (TCGA) database and analyzed clinical samples to show that the long noncoding antisense transcript of nicotinamide phosphoribosyltransferase (NAMPT), NAMPT-AS, is upregulated in TNBC and is associated with poor prognosis, lymph node involvement, metastasis, and advanced stage. NAMPT-AS was cotranscribed with NAMPT from a bidirectional promoter, where the distributions of H3K4me3 and H3K27Ac chromatin modifications were enriched based on ENCODE and FANTOM5, suggesting the potential enhancer-RNA characteristics of NAMPT-AS. NAMPT-AS epigenetically regulated the expression of NAMPT in two divergent ways: NAMPT-AS recruited POU2F2 to activate the transcription of NAMPT, and NAMPT-AS acted as a competing endogenous RNA to rescue NAMPT degradation from miR-548b-3p. NAMPT-AS/NAMPT promoted tumor progression and regulated autophagy through the mTOR pathway in vitro and in vivo. In a cohort of 480 breast cancer patients, NAMPT was associated with breast cancer–specific survival and overall survival. These results demonstrate that NAMPT-AS is an oncogenic lncRNA in TNBC that epigenetically activates NAMPT to promote tumor progression and metastasis. Furthermore, these data identify NAMPT-AS/NAMPT as promising therapeutic targets in patients with TNBC. Significance: Upregulation of the long noncoding antisense RNA of NAMPT gene (NAMPT-AS) is associated with metastasis and poor prognosis in TNBC.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».