Characterizing Thyroid Hormone Mediated Action on Gene Expression in Mice: Mechanistic Insight into Thyroid Hormone Response Elements, Thyroid Hormone Receptor-binding Sites, and MicroRNAs
Notice bibliographique
Résumé
Genes identified as being directly regulated by THs.39 2.2Microarray and RT-qPCR results for known TH-regulated genes.41 2.3Microarray and RT-qPCR results for the male hypo+ and male hypo++ treatment groups.42 2.4TREs identified using bioinformatics searches of promoter regions of genes characterized as being directly regulated by THs.44 3.1Differentially expressed miRNAs in hypothyroid mouse liver.71 3.2Serum T4 levels of male pups in the various animal models.73 3.3Targets of miRs-1, 206, 133a and 133b that were significantly altered in hypothyroid mouse liver.79 4.1Genes associated with TR-binding site peaks found in all liver samples.98 4.2Putative TREs identified within top TR-binding sites peaks.104 4.3Fold changes determined by RT-qPCR for gene expression in the livers of juvenile.107 5.1Half-site organization for TRE constructs.129 SP2.1Altered genes in male pups, with a FDR-adjusted p < 0.05 in at least one of the treatment conditions.171 SP2.2 Altered genes in female pups, with a FDR-adjusted p < 0.05 in at least one of the treatment conditions.177 SP2.3The five most affected pathways, using the list of all significant along with the names of the genes that were affected by TH treatment within the pathway.186 SP4.1Genes associated with TR-binding site peaks found in at least two samples. 3.4Identification of the target genes of miR-206 regulated by TH. 81 4.1 Relative enrichment of TR binding sites identified by ChIP-chip using ChIP-PCR and gel quantification.101 4.2 Ddx54 expression in response to T3 in AML12 cells measured by RT-qPCR.109 4.3 Transcriptional activity determined by luciferase reporter assay for DR4.112 4.4 Alignment of the mouse and rat Thrsp promoter regions.Mm9 corresponds to mouse genome build 9 and Rn5 corresponds to rat genome build 5. 115 5.1 Transcriptional activity determined by luciferase reporter assay for DR4, IR0 and ER6.132 xi 5.2 Antagonistic effects of 1-850 determined by luciferase reporter assay for DR4.134 6.1 Summary of molecular mechanisms controlling TH-induced changes in mRNA levels revealed in this thesis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».