New three-stage in vitro model for infant colonic fermentation with immobilized fecal microbiota
Notice bibliographique
Résumé
In the paper by Cinquin et al. (2006), some footnote symbols were reproduced incorrectly in Tables 2 and 3, and there was also an error in the symbols in the legend to Fig. 2. Bacterial populations measured by plate counts and fluorescence in situ hybridization in effluent samples from the three reactor stages at the pseudo-steady state and in fecal inocula for fermentation F1 (13 and 10 g L−1 of carbohydrate concentrations) and F2 (10 g L−1 of carbohydrate concentrations) FISH counts significantly different from plate counts at the significance level: *P<0.05, **P<0.005, ***P<0.0005. Effects of fermentation section (PCS, TCS and DCS) on bacterial populations: values with different letters (capitals for plate counts and small letters for FISH) are significantly different by Tukey-Kramer HSD test (P<0.05). Data are mean values calculated for the last 4 and 2 days for each fermentation period for plate counts and FISH, respectively. PCS, proximal colon simulation; TCS, transverse colon simulation; DCS, distal colon simulation; PC, plate counts; nd, not determined; ND, not detected, value below the detection threshold of the FISH method which was 6.8 Log 10 cell number per mL for effluent samples and 7.5 Log 10 cell number per g for wet feces. Metabolite concentrations and ratios in effluent samples from the three reactor stages at the pseudo-steady state and fecal inocula for fermentation F1 (13 and 10 g L−1 of carbohydrates) and F2 (10 g L−1 of carbohydrates) SCFA concentrations in F1 (10 g L−1 total carbohydrate) significantly different from SCFA concentrations in F1 (13 g L−1 total carbohydrate) at the significance level: *P<0.05, **P<0.005, ***P<0.0005. Effects of fermentation section (PCS, TCS and DCS) on metabolites concentrations: values with different letters are significantly different by Tukey-Kramer HSD test (P<0.05). ‡Pooled SEM, pooled standard errors of the mean. Data are mean values calculated for the last 4 days of each period. PCS, proximal colon simulation; TCS, transverse colon simulation; DCS, distal colon simulation; PC, plate counts; nd, not determined; ND, not detected, value below the detection threshold of the HPLC method (2 mM). Viable bacterial counts of total and facultative anaerobe populations in proximal (PCS) and distal (DCS) effluent from fermentation F2 with total carbohydrate concentration of 10 g L−1: total anaerobes (), bifidobacteria (), bacteroides (), clostridia (), facultative anaerobes (), Gram+cocci (), staphylococci (), coliforms (), lactobacilli (), pH (—). RBC (repeated batch cultures) corresponding to beads precolonization. Tables 2 and 3 and Fig. 2 are reproduced correctly here. The publishers apologize for this error.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».