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Enregistrement W4244360800 · doi:10.1128/9781555818982.ch12

The CRISPR-Cas Immune System and Genetic Transfers: Reaching an Equilibrium

2015· book-chapter· en· W4244360800 sur OpenAlex
Julie Samson, Alfonso H. Magadán, Sylvain Moineau

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueASM Press eBooks · 2015
Typebook-chapter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCRISPRImmune systemBiologyGeneticsComputational biologyComputer scienceGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In 1987 Ishino et al. (1) sequenced the Escherichia coli alkaline phosphatase isozyme conversion gene (iap). Downstream of iap, they observed an array of short repeats (29 nucleotides) separated by nonrepetitive short sequences (spacers) (2). The terms “CRISPR,” for clustered regularly interspaced short palindromic repeats, and “Cas,” for CRISPR-associated genes, were first coined by Jansen et al. (3) in 2002 to describe the genetic structure of these loci. The increasing availability of genomic sequences in databases allowed Mojica et al. (4) to identify CRISPR as a specific family of repeats. Now we know that CRISPR-Cas systems are found in approximately 90% of archaeal and 40% of eubacterial sequenced genomes (5 – 7). In 2005, three groups independently reported similarities between spacer sequences and foreign mobile genetic elements (MGEs) such as phages and plasmids (8 – 10). These observations led to several hypotheses including that CRISPR-Cas systems may play a role in immunity and protect archaeal and bacterial cells from invasion by foreign DNA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,835
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle