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Enregistrement W4246161037 · doi:10.20328/vjsonline.2015.rr2

Disulfide bond formation of heterodimer and heterotrimer of human laminin-332 coiled-coil domains

2015· article· en· W4246161037 sur OpenAlexaff
Phuong Mai Hoang, Yasuo Phan, Tomoaki Kitagawa

Notice bibliographique

RevueVietnam Journal of Science · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesIwatani Naoji Foundation
Mots-clésCoiled coilDisulfide bondLamininChemistryCell biologyBiophysicsBiochemistryBiologyCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Laminin (LM) α, β, and γ chains were connected by disulfide bonds at the C-and N-termini of the LM coiled-coil (LCC) domain to form heterodimers and heterotrimers.At the Cterminus of LCC domain, one disulfide bond is formed to connect β and γ chains while it was unclear how disulfide bond pattern is formed to connect α, β, and γ chains at the Nterminus of LCC domain.Using an insect cell-free translation system, we succeeded to produce heterotrimers of LCC domain of human LM-332.To analyze disulfide bond formation at the N-terminus of LCC domain, we mutated cysteines of LCC domains into alanines by site-directed mutagenesis and co-expressed these mutants in an insect cell-free translation system.Mutation of a single cysteine at the N-terminus of LCC domain of one chain caused the failure of disulfide bond formation of heterotrimers.However, mutation of cysteines at the N-terminus of LCC domain of two different chains recovered the disulfide bond formation of heterotrimers with different efficiencies.These results suggest that the disulfide bond patterns at the N-terminus of human LM-332 LCC domains are not specific.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,347
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
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