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Enregistrement W4246528609 · doi:10.21203/rs.3.rs-16251/v1

X-linked muscular dystrophy in a Labrador Retriever strain: phenotypic and molecular characterization.

2020· preprint· en· W4246528609 sur OpenAlexaboutno aff
Inès Barthélémy, Nadège Calmels, Robert B. Weiss, Laurent Tiret, Adeline Vulin, Nicolas Wein, Cécile Peccate, Carole Drougard, Christophe Béroud, Nathalie Deburgrave, Jean‐Laurent Thibaud, Catherine Escriou, Isabel Punzón, Luis Garcı́a, Jean‐Claude Kaplan, Kevin M. Flanigan, France Leturcq, Stéphane Blot

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle Physiology and Disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institutes of HealthCentres de Recerca de Catalunya
Mots-clésLabrador RetrieverStrain (injury)PhenotypeMuscular dystrophyGeneticsMedicineBiologyPathologyAnatomyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Canine models of Duchenne muscular dystrophy (DMD) are valuable to evaluate therapies because they faithfully reproduce the human disease. Several cases of dystrophinopathies have been described in canines, but the GRMD (Golden Retriever Muscular Dystrophy) model remains the one used in most preclinical studies. Methods We report a new spontaneous dystrophinopathy in a Labrador retriever strain, named LRMD (Labrador Retriever Muscular Dystrophy), for which a colony was established. Fourteen LRMD dogs were followed-up and compared to the GRMD standard. Results The clinical features of the GRMD disease were found in LRMD dogs, and the functional tests provided data roughly overlapping those measured in GRMD dogs, with similar inter-individual heterogeneity. Molecular techniques including RNA-sequencing allowed to map and identify the LRMD causal mutation, consisting in a 2.2-Mb inversion disrupting the DMD gene within its intron 20, and involving TMEM47 gene. In skeletal muscles, the Dp71 isoform was ectopically expressed as a probable consequence of the mutation. We found no evidence of polymorphism in the two LTBP4 and Jagged1 modifier genes that would explain the observed inter-individual variability. Conclusions This study provides a full comparative description of a new spontaneous canine dystrophinopathy, that we demonstrate is phenotypically equivalent to the GRMD model. We report a novel large DNA mutation within the DMD gene and provide evidence that LRMD is a relevant model to pinpoint additional DMD modifier genes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,326
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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