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Enregistrement W4247389132 · doi:10.31219/osf.io/4k2yt

A DNA investigation into the mysterious disappearance of the Rocky Mountain grasshopper, mega-pest of the 1800s

2017· preprint· en· W4247389132 sur OpenAlexfundno aff
W. Chapco, G. Litzenberger

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueOrthoptera Research and Taxonomy
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAcademy of Natural Sciences of Drexel UniversityNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMcGill UniversityColorado State University
Mots-clésGrasshopperDemiseMitochondrial DNAEcologyPEST analysisBiologyExtinction (optical mineralogy)Extant taxonSister groupZoologyEvolutionary biologyPhylogenetic treePaleontologyBotanyCladeGeneticsLaw

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The mysterious extinction of the Rocky Mountain Grasshopper, Melanoplus spretus, a major pest species on the prairies and plains of the 1800s, is truly a remarkable event in the history of agriculture. Recently, we obtained specimens of M. spretus from museums and from 400-year-old glacial deposits in Wyoming. We report success in obtaining mitochondrial DNA sequences from both sources. This permitted us to examine two issues surrounding the species’ disappearance. First, a long-standing view that M. spretus and the extant species Melanoplus sanguinipes are (if not phase transforms of one another) sister taxa, is disputed, but cannot be rejected with certainty. Interestingly, there is some evidence that suggests there may be a closer affinity with another member of the Mexicanus species-group, Melanoplus bruneri. Second, because M. spretus still possesses considerable nucleotide diversity (1.15 ± 0.19%), a depletion of variation cannot be considered a factor contributing to its demise.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,293
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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