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Enregistrement W4248200329 · doi:10.1093/auk/121.3.682

Vicariant Speciation of Curassows (Aves, Cracidae): A Hypothesis Based on Mitochondrial DNA Phylogeny

2004· article· en· W4248200329 sur OpenAlexaff
Sérgio L. Pereira, Allan J. Baker

Notice bibliographique

RevueThe Auk · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensRoyal Ontario MuseumUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVicarianceBiologyAllopatric speciationMonophylyPhylogenetic treePhylogeneticsZoologyEvolutionary biologyCladeGenusGeneGeneticsPopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The curassows comprise 14 species of sedentary Neotropical birds classified in four genera (Crax, Nothocrax, Mitu, and Pauxi) in the family Cracidae. Congeneric species have a striking pattern of allopatric distributions that might be attributable to vicariance, dispersal, or a combination of the two. To test those biogeographic hypotheses, a strongly supported phylogeny was needed, so that existing problems of taxonomic rank could be solved and a better understanding of the group's evolutionary history attained. We therefore estimated the phylogenetic relationships of all 14 species, on the basis of 6,929 sites of six different mitochondrial DNA regions, and reassessed the status of the four genera. Sequences from the ND4 gene favored a tree that was highly incongruent with the tree recovered using the other five gene regions. However, when the ND4 sequences were concatenated with the sequences of the other genes, the optimal phylogeny was unchanged from that derived for the other genes. That combined tree was divided into two well-supported clades: one containing the seven species of Crax and the other containing the monospecific genus Nothocrax, as sister to a clade of the Mitu and Pauxi species. Mitu and Pauxi are not reciprocally monophyletic, which appears to be attributable to a distant hybridization event and a transfer of Mitu mtDNA into P. unicornis. We estimated divergence times; the diversification of curassow seems to have occurred from the Middle Miocene to the end of the Pliocene (9.5 to 1.6 Ma). Vicariance—following marine transgressions, the rise of the Andes, and subsequent changes in river basins in South America—seems to be the major mode of isolation that favored allopatric speciation in the group.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,151
Score d'incertitude au seuil0,272

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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