Abstract 3461: Characterizing the PTEN - p85alpha interaction
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Introduction: The phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K) pathway plays a key role in regulating cell growth and cell survival and is frequently deregulated in cancer cells. p85α regulates the p110α lipid kinase, and also stabilizes and stimulates PTEN, the lipid phosphatase that downregulates this pathway. We set out to identify residues in both PTEN and p85α that mediate their interaction to better understand the regions important in mediating binding. Experimental Procedures: We previously showed that the BH domain of p85α is sufficient to mediate binding to PTEN. In this work, a deletion analysis and point mutations were used to mutate each of PTEN and the p85α BH domain to identify residues important for binding, determined using a pull-down analysis. Mutations in the p85α BH domain and in PTEN that reduced their interaction were then used as input data and docking software was used to model possible interaction interfaces for the two the proteins. Further mutagenesis and follow-up binding experiments provided support for our model of the PTEN - p85α BH domain complex. Results: We identified key residues responsible for mediating PTEN - p85α complex formation. Based on these experimental results, a docking model for the PTEN - p85α BH domain complex was developed that is consistent with the known binding interactions for both PTEN and p85α. This model involves extensive side-chain and peptide backbone contacts between both the PASE (R84, Q87, Y88, E91, E99) and C2 (R189, P190, Q219, C250, D252) domains of PTEN and the p85α BH domains with a buried surface area of 1211 Å2 (PTEN - bovine p85α BH) and 1366 Å2 (PTEN - human p85α BH). The p85α BH domain residues that directly contact PTEN in the two docking models were not identical, however both models implicated p85α residues E212, Q221, K225, R228, H234 and W237. The majority of these p85α BH domain residues were confirmed experimentally as important for PTEN binding. We also verified experimentally the importance of PTEN-E91 in mediating interaction with the p85α BH domain. Conclusions: These results shed new light on the mechanism of PTEN binding and regulation by p85α. Citation Format: Jeremy Marshall, Paul Mellor, Xuan Ruan, Dielle Whitecross, Stanley Moore, Deborah Anderson. Characterizing the PTEN - p85alpha interaction [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2019; 2019 Mar 29-Apr 3; Atlanta, GA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2019;79(13 Suppl):Abstract nr 3461.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».