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Investigating the Relationship Between Central Computer Tomography Airway Tree Features and Small Airways Disease in Chronic Obstructive Pulmonary Disease

2021· article· en· W4249428256 sur OpenAlexaffabout
Xavier Bauza, Daniel Genkin, J.C. Hogg, J. Bourbeau, Wan C. Tan, Miranda Kirby

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Obstructive Pulmonary Disease (COPD) Research
Établissements canadiensSt. Paul's HospitalToronto Metropolitan University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAirwayCOPDMedicineExpirationVoxelTomographyRadiologyInternal medicineRespiratory systemSurgery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rationale: Chronic Obstructive Pulmonary Disease (COPD) results in remodeling of both the large and small airways. Computed tomography (CT) imaging allows quantification of morphometric features from the central airways to be measured directly from a single full-inspiration acquisition, and small airway disease (SAD) features indirectly by registering full-inspiration to full-expiration images, known as Disease Probability Measure (DPM SAD ). Our objective is to investigate the relationship between CT central airway tree and DPM SAD features in COPD. Methods: Full-inspiration and full-expiration CT images were obtained from the Canadian Cohort of Obstructive Lung Disease (CanCOLD) study. Image registration and airway segmentation was performed (VIDA Diagnostics Inc.). Central CT airway tree features were generated in each of the 19 bronchopulmonary segments, including measurements reflecting the airway dimensions (lumen diameter, wall area, total airway count, airway tapering), the direction (branch angle, directional cosines) and statistical features (mean, min, max of a given feature). CT DPM SAD measurements were generated by co-registration of full-inspiration to full-expiration CT images. Each voxel was classified as either normal, emphysema or SAD and expressed as the percentage of the total lung volume. DPM SAD was generated in each bronchopulmonary segment to be spatially matched with the regional airway features. For statistical analysis, airway features with high collinearity (r>0.70) were removed. The remaining features were inputted into a mixed effects beta regression model treating participants and bronchopulmonary segments as random effects and the airway features as fixed effects. A null model without airway tree features was generated to compare the AIC and BIC values to assess model fit and a likelihood ratio test was performed. Results: A total of 318 participants were evaluated: n=17 Healthy, n=92 At-Risk, n=114 mild COPD, and n=95 with moderate-severe COPD. A total of 79 features were extracted from central airways; after adjusting for collinearity 16 features remained. Of the remaining features, 8/16 were significantly associated with DPM SAD measurements in the mixed effects beta regression model (P<0.05). There was a significant difference (P<0.0001) between the null model (AIC=-8859.8, BIC=-8827.0) and the airway tree model (AIC=-9967.9, BIC=-9830.1). Significant airway features included: average wall thickness (=0.039), max and min wall thickness using the major diameter (=0.017, =-0.031, respectively), total airway count (=-0.020), airway tapering (=0.019), and directional cosines of the airway in each direction (X: =-0.032,Y: =-0.175, Z: =-0.164). Conclusion: Central airway tree features were associated with measurements reflecting small airway disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,051

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission2
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