Folding in Place: Design of β-Strap Motifs to Stabilize the Folding of Hairpins with Long Loops
Notice bibliographique
Résumé
Despite their pivotal role in protein function and antibody binding affinity, <i>β</i>-hairpins bearing long non-canonical loops are a challenge to modern synthesis because of the large entropic penalty associated with their folding. Little is known about the contribution and impact of stabilizing motifs on the folding of <i>β</i>-hairpins of variable length and plasticity. Here we report a direct comparison between these <i>b</i>-straps thermodynamics and their thermal stability behavior using several local spectroscopic probes of the folding/unfolding landscape. The judicious cooperative interactions crafted in <i>β</i>-Strap <u>R</u>W(<u>V</u>W)•••(W<u>V</u>/<u>H</u>)W<u>E</u> (<i>strap</i> = <i>str</i>and + c<i>ap</i>) greatly stabilized hairpins with up to 10-residue loops lacking an innate nucleating-turn locus (<i>T<sub>m</sub> </i>up to 52 <sup>o</sup>C; 88 ± 1% folded at 291 K). The present design of novel <i>β</i>-straps aims to provide the foundation to study new classes of long hairpins and ultimately offer an attractive alternative to macrocyclic peptides for the mimicry of functional loops from proteins and antibodies.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».