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Enregistrement W4250928842 · doi:10.22215/etd/2016-11592

Examining the role of the promoter region of het-6 in escape from heterokaryon incompatibility in Neurospora crassa

2016· dissertation· en· W4250928842 sur OpenAlexaff
Abiodun Laoye

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNeurospora crassaBiologyHeterokaryonGeneticsGeneMutantAlleleCrassaNeurosporaNull allele

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Heterokaryon incompatibility (HI) is a form of nonself recognition that limits the formation of heterokaryons -cells that contain genetically dissimilar nuclei.HI is controlled by several het loci.One of these, het-6 is a supergene complex that encodes two tightly-linked incompatibility genes, un-24 and het-6, with allelic variants Oak Ridge (OR) and Panama (PA), and only two natural haplotypes -un-24 OR het-6 OR or un-24 PA het-6 PA .het-6 encodes a HET domain protein with no known function outside of incompatibility, whereas un-24 encodes incompatibility function and the large subunit of ribonucleotide reductase.Strains incompatible at the het-6 locus can 'escape' from HI by mutation in the het-6 gene (Type I, ~97%), or suppress HI by mutation in a transcription factor called vib-1 (Type II, ~3%).This study examined the possible role of the het-6 promoter region in the initiation of escape, by introducing an ectopic het-6 OR allele into a strain that carried a null endogenous het-6 OR allele (IB20).Self-incompatible transformants exhibited delayed escape and aberrant post-escape behavior.A vib-1 mutant allele was introduced into IB20, and the resulting strain was also transformed with the ectopic het-6 OR .Transformants displayed Type-II like phenotype, but had slower growth rates than a typical Type II strain.Finally, we constructed a plasmid containing the het-6 OR allele in which the putative VIB-1 + binding site was deleted.Transformation of IB20 with this construct generated a transformant with a Type II-like growth phenotype.This study provides insight into the process of escape.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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