Examining the role of the promoter region of het-6 in escape from heterokaryon incompatibility in Neurospora crassa
Notice bibliographique
Résumé
Heterokaryon incompatibility (HI) is a form of nonself recognition that limits the formation of heterokaryons -cells that contain genetically dissimilar nuclei.HI is controlled by several het loci.One of these, het-6 is a supergene complex that encodes two tightly-linked incompatibility genes, un-24 and het-6, with allelic variants Oak Ridge (OR) and Panama (PA), and only two natural haplotypes -un-24 OR het-6 OR or un-24 PA het-6 PA .het-6 encodes a HET domain protein with no known function outside of incompatibility, whereas un-24 encodes incompatibility function and the large subunit of ribonucleotide reductase.Strains incompatible at the het-6 locus can 'escape' from HI by mutation in the het-6 gene (Type I, ~97%), or suppress HI by mutation in a transcription factor called vib-1 (Type II, ~3%).This study examined the possible role of the het-6 promoter region in the initiation of escape, by introducing an ectopic het-6 OR allele into a strain that carried a null endogenous het-6 OR allele (IB20).Self-incompatible transformants exhibited delayed escape and aberrant post-escape behavior.A vib-1 mutant allele was introduced into IB20, and the resulting strain was also transformed with the ectopic het-6 OR .Transformants displayed Type-II like phenotype, but had slower growth rates than a typical Type II strain.Finally, we constructed a plasmid containing the het-6 OR allele in which the putative VIB-1 + binding site was deleted.Transformation of IB20 with this construct generated a transformant with a Type II-like growth phenotype.This study provides insight into the process of escape.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».