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Enregistrement W4252084060 · doi:10.24124/2005/bpgub370

An examination of genetic variation and disease spread in Inonotus tomentosus in the sub-boreal spruce zone of British Columbia.

2005· dissertation· en· W4252084060 sur OpenAlexaffabout
Susan E. Gibson

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensUniversity of Northern British ColumbiaLibrary and Archives Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGenetic variationAnalysis of molecular varianceGenetic diversityBiological dispersalPopulationLinkage disequilibriumGenetic structureBotanyEcologyGenotypeGeneticsHaplotypeDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Inonotus tomentosus (Fr) Teng. is a fungal pathogen of commercially valuable tree species in British Columbia and one of the most important biotic disturbance agents in sub-boreal and boreal forests in Canada. This study investigated the population variation in six spruce stands infected with Tomentosus Root Rot (TRR) in order to determine whether infection is due to spread by root contact, by basidiospores, or a combination of the two and if forest management affects the mode of disease spread. Three marker types were used to test for variation in populations. These included vegetative compatibility (VC), random amplified polymorphic DNA (RAPDs) and single strand conformation polymorphisms (SSCP). Genetic and genotypic variation as well as linkage disequilibrium and random mating were measured. There is high genotypic variation within all populations in addition to moderate levels of gene diversity, significant linkage disequilibrium and significant deviation from Hardy- Weinberg Equilibrium. Analysis of Molecular Variance (AMOVA) indicated that 70% of genetic variation occurred within populations and 28% occurred between populations. This indicates that some clonal propagation is occurring in these populations but frequent recombination (i.e. sexual reproduction) and subsequent spore dispersal (although spatially limited) is the most likely cause of the high level of genotypic diversity observed in these sites. There was no apparent difference in the population structure of this pathogen between unmanaged mixed-species stands and spruce plantations. Given this information, the current management guidelines for treating sites affected by TRR may be insufficient because many of them are aimed at interfering with spread by root contacts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,410
Score d'incertitude au seuil0,826

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2005
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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