Isolation and Characterization of a cDNA Clone Encoding One IgE-Binding Fragment of <i>Penicillium brevicompactum</i>
Notice bibliographique
Résumé
<i>Background:</i>The abundance of allergenic <i>Penicillium</i> species has been associated with an increased incidence of childhood asthma and pulmonary bleeding. <i>Penicillium brevicompactum </i>has been identified as the most prevalent indoorspecies of this genus. However, detailed studies on the allergens of the ubiquitous <i>Penicillium </i>species are still lacking. For the characterization of allergens of prevalent <i>Penicillium </i>species, molecular cloning of the allergen genes of <i>P. brevicompactum</i> was performed in the present study. <i>Methods:</i>A phage cDNA library of <i>P. brevicompactum</i> was constructed in Uni-ZAP<sup>®</sup> XR vector using mRNA isolated from the organism. The cDNA library of <i>P.</i><i>brevicompactum</i> was screened using pooled atopic sera. <i>Results:</i> Screening of <i>P. brevicompactum</i> cDNA library resulted in one positive clone encoding an estimated molecular weight of 11 kDa polypeptide, rich in acidic residues (>20%), with a pI of 3.87. This clone was designated as <i>Pen b </i>26 and found to be reactive only against the atopic sera obtained from individuals sensitive to <i>P. brevicompactum</i>. The amino acid sequence analysis of <i>Pen b </i>26 revealed that it had strong homology to the 60S acidic ribosomal protein P1 family from different eukaryotic sources, predominantly fungal aero-allergens. Other features of <i>Pen b </i>26 including having high alpha-helical content (>50%), alanine-rich residues (>20%), and a well-conserved C-terminal epitope region fits well into the common properties of 60S acidic ribosomal proteins. <i>Conclusions:</i>The results obtained suggest that the allergenic clone, <i>Pen b </i>26 is a 60S acidic ribosomal protein P1 of <i>P. brevicompactum</i> and shows strong similarity to other P1 family proteins.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».