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Enregistrement W4252461758 · doi:10.32920/ryerson.14662083.v1

Synthesis Of Molecular Probes For Cystic Fibrosis Research

2021· preprint· en· W4252461758 sur OpenAlexaff
Bashar Alkhouri

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensToronto Metropolitan University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCystic fibrosis transmembrane conductance regulatorCystic fibrosisMutantMembrane proteinMutationPhosphorylationCell biologyChemistryChloride channelTransmembrane proteinIon channelMutant proteinMembraneBiologyBiochemistryGeneGeneticsReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cystic fibrosis (CF) is caused by mutations in the gene coding for the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) protein. In healthy individuals, CFTR acts as a phosphorylation and nucleotide regulated channel which mediates the flux of chloride ions across the membrane of epithelial cells. The most common genetic lesion is deletion of phenylalanine residue 508 (F508del-CFTR). The mutation leads primarily to misfolding of the protein, resulting in degradation of most of the protein before it reaches the cell membrane. Also, any F508del-CFTR in the membrane exhibits reduced ion channel activity. The drug-like small molecule VRT-532 has been shown to improve both the trafficking of F508del-CFTR to the cell membrane, as well as its channel function. The exact nature of the interaction of VRT-532 with mutant CFTR is not fully understood. The goal of this research is to help reveal the nature of interaction between VRT-532 and mutant CFTR protein by synthesizing derivatives useful in biochemical studies. Understanding the molecular basis for this interaction will provide us with a template for the development of therapeutically efficacious compounds.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,085

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0260,012

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,400
Écart entre enseignants0,345 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
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Résumé présentoui

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