MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4253243851 · doi:10.1002/9781118960608.gbm00976

<i>Eikenella</i>

2015· other· en· W4253243851 sur OpenAlexaff
Edward J. Bottone, F. L. Jackson, Yvonne E. Goodman

Notice bibliographique

RevueBergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria · 2015
Typeother
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Phylogenetic Studies
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEikenella corrodensMicrobiologyBiologyBacteroidesNutrient agarGliding motilityAgarBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Ei.ke.nel'la. M.L. dim. ending ‐ ella ; M.L. fem. n. Eikenella named after M. Eiken, who first named the type species of the genus. Straight rods, 0.3–0.4 × 1.5–04.0 µm, unbranched, with rounded ends and a regular morphology. Short filaments are occasionally formed. Nonsporeforming. Gram negative. Nonmotile , possessing no flagella; however, a “twitching motility” may occur on agar surfaces. Facultatively anaerobic . Optimal growth temperature, 35–37°C. Colonies may appear to corrode the surface of the agar ; noncorroding strains may also occur. Nonhemolytic; a slight greening of blood media around colonies may occur. Oxidase positive (Kovacs method). Negative for catalase , urease , arginine dihydrolase , and indole . Lysine‐decarboxylase positive . Nitrates are reduced to nitrites. No acid is formed from glucose or other carbohydrates . Hemin is usually required for growth under aerobic conditions . Occur in the human mouth and intestine; can be opportunistic pathogens. The mol % G + C of the DNA is : 56–58. Type species : Eikenella corrodens (Eiken 1958) Jackson and Goodman 1972, 75 ( Bacteroides corrodens Eiken 1958, 415.) Taxonomic and Nomenclature Notes According to the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), the taxonomic status of the genus Eikenella is: correct name (last update, February 2025) * . LPSN classification: Bacteria / Pseudomonadati / Pseudomonadota / Betaproteobacteria / Neisseriales / Neisseriaceae / Eikenella The genus Eikenella can also be recovered in the Genome Taxonomy Database (GTDB) as g__Eikenella (version v220) ** . GTDB classification: d__Bacteria / p__Pseudomonadota / c__Gammaproteobacteria / o__Burkholderiales / f__Neisseriaceae / g__Eikenella * Meier‐Kolthoff et al. ( 2022 ). Nucleic Acids Res , 50 , D801 – D807 ; DOI: 10.1093/nar/gkab902 ** Parks et al. ( 2022 ). Nucleic Acids Res , 50 , D785 – D794 ; DOI: 10.1093/nar/gkab776

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,513
Score d'incertitude au seuil0,893

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBergey's Manual of Systematics of Archaea and BacteriaMême sujetGenomics and Phylogenetic StudiesTravaux en français237 207