MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4253817409 · doi:10.1093/jexbot/52.359.1239

The cloning and characterization of α‐galactosidase present during and following germination of tomato (Lycopersicon esculentum Mill.) seed

2001· article· en· W4253817409 sur OpenAlexaff
J. Allan Feurtado, Mitali Banik, J. Derek Bewley

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Botany · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEnzyme Production and Characterization
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEndospermBiologyGerminationLycopersiconAmino acidComplementary DNAEndoplasmic reticulumPeptide sequenceGeneBiochemistryBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

α‐Galactosidase (EC 3.2.1.22) is present in the embryo, micropylar and lateral endosperm of seeds of tomato during and following germination. Its activity is unchanged even when germination of the seeds is prevented by an osmoticum. It is also present in the developing and mature dry seed. A cDNA clone for tomato seed α‐galactosidase (LeaGal) has been isolated and the characteristics of the protein deduced; the predicted molecular mass of the mature enzyme is 39.8 kDa, with a pI of 4.91. The tomato α‐galactosidase has a high homology (>62%) at the amino acid level with that of other plant α‐galactosidases. A hydrophobic signal peptide region is identified which is indicative that the enzyme enters the lumen of the endoplasmic reticulum during its translation, prior to its export to the protein body or cell wall, the presumed sites of its substrates. Using amino acid alignment and phylogenetic analysis, key amino acids have been identified, and relationships to other α‐galactosidases inferred. Southern hybridization analyses show that the enzyme is derived from a single gene (for which a partial sequence has been obtained) and yet there are at least three different isoforms within the seed; post‐translational modifications are thus presumed to occur. From Northern hybridization studies it is evident that α‐galactosidase transcripts are present in the lateral and micropylar endosperm during and following germination, and also to a lesser extent in the embryo.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Experimental BotanyMême sujetEnzyme Production and CharacterizationTravaux en français237 207