Communications orales en session simultanées (CS01 – CS66)
Notice bibliographique
Résumé
maladie.Mais si certaines pathologies sont fréquentes, d'autres sont rares ( 1 seul cas publié), en particulier pour certaines sous-entités cytogénétiques de leucémies... et il y a plus de 650 sous types leucémies !De 2 000 à 9 000 gènes sont peut être impliqués dans le cancer, et 25 000 nouvelles publications concernant la génétique des cancers chez l'homme ont été ajoutées en 2008 sur PubMed.Ainsi, même le meilleur spécialiste ne peut connaître tout ce qu'il devrait pourtant connaître.Il est donc essentiel que cette masse de savoirs soit à disposition de quiconque, soignant comme chercheur.Hypothèse : Pour cela il fallait créer une base de données sur internet.Etat des lieux : L'Atlas est un journal/encyclopédie/base de données consacrée aux gènes, entités cytogénétiques ou cliniques du cancer, et maladies héréditaires à risque accru de cancer.Il est le résultat de l'effort collectif de cliniciens et chercheurs, au service de tous, y compris enseignants et étudiants.Objectifs : L'Atlas participe au projet génome et aux recherches en épidémiologie des cancers.L'Atlas est au carrefour de la recherche, de l'enseignement universitaire et post-universitaire (université médicale virtuelle, formation médicale continue) et de la télémédecine (aide au diagnostic).Il contribue à la « meta-médecine », médiation entre le flux débordant d'informations apporté par la communauté scientifique d'une part, et le médecin praticien d'autre part.Il aide le cytogénéticien dans son diagnostic et le clinicien dans son choix thérapeutique.L'Atlas est en accès libre, gratuit, ce qui est crucial pour nos collègues du tiers monde.Spécificité de l'Atlas : L'Atlas combine différents savoir sur un seul site : gènes et leur fonction, biologie cellulaire, maladies et implications cliniques, cytogénétique, bien sûr, mais aussi génétique clinique, avec les maladies héréditaires à risque accru de cancer.Cela unifie en un même concept les différents aspects de la génétique des cancers, ailleurs dispersés entre divers sites.L'iconographie aussi est diverse diverse (imagerie médicale, ana-path, chromosomes, structure 3-D des protéines, cartographie génétique...) et abondante (plus de 1 800 images).C'est enfin le seul site de génétique où le pronostic est donné !Résultats attendus : En un an, l'Atlas a accepté et publié plus de 230 articles.L'Atlas atteint maintenant 30 000 pages, écrites par 1 100 authors... et we need more authors !Nous développons maintenant une version'electronique' comprenant 60 volumes, de 1997 à fin 2009, comportant environ 1 800 articles, soit 9 500 pages pdf.Devenir un véritable journal international indexé dans PubMed sera une étape majeure dans le développement de l'Atlas.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,014 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,006 | 0,005 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,784 | 0,515 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».