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Record W4254787985 · doi:10.1051/medsci/2010261s10

Communications orales en session simultanées (CS01 – CS66)

2010· article· fr· W4254787985 on OpenAlexaff
L Outil, Bioinformatique Mirifix, Claude Mugnier, Simonetta Bandiera, M Girard, M Le Mener, Arnold Münnich, Stanislas Lyonnet, Alexandra Henrion‐Caude, Ruth Bargal, Valérie Cormier‐Daire, Ziva Ben‐Neriah, M. Le Merrer, Jacob Sosna, Judith Melki, Sarah Smithson, R Belos, Annick Raas‐Rothschild, Microdélétions Des, Avec Sévère, Stéréotypes Des, Une Gestuels, Épilepsie, Des Ou, Cérébrales Malformations, Nathalie Le Meur, Muriel Holder‐Espinasse, Anna Goldenberg, Patrizia Amati‐Bonneau, Hubert Journel, Kerckaert Jp, S Manou- Vrier, Véronique David, Pascale Saugier-Véber, Benoı̂t Arveiler, Dávid Simon, Benoît Laloo, M. Barillot, Thomas Barnetche, Caroline Rooryck, Ingrid Burgelin, Michèle Marche, Isabelle Coupry, Nicolas Chassaing, Christophe F. Grosset, Didier Lacombe

Bibliographic record

Venuemédecine/sciences · 2010
Typearticle
Languagefr
FieldHealth Professions
TopicHealth, Medicine and Society
Canadian institutionsSt. Michael's Hospital
Fundersnot available
KeywordsSession (web analytics)Computer scienceWorld Wide Web

Abstract

fetched live from OpenAlex

maladie.Mais si certaines pathologies sont fréquentes, d'autres sont rares ( 1 seul cas publié), en particulier pour certaines sous-entités cytogénétiques de leucémies... et il y a plus de 650 sous types leucémies !De 2 000 à 9 000 gènes sont peut être impliqués dans le cancer, et 25 000 nouvelles publications concernant la génétique des cancers chez l'homme ont été ajoutées en 2008 sur PubMed.Ainsi, même le meilleur spécialiste ne peut connaître tout ce qu'il devrait pourtant connaître.Il est donc essentiel que cette masse de savoirs soit à disposition de quiconque, soignant comme chercheur.Hypothèse : Pour cela il fallait créer une base de données sur internet.Etat des lieux : L'Atlas est un journal/encyclopédie/base de données consacrée aux gènes, entités cytogénétiques ou cliniques du cancer, et maladies héréditaires à risque accru de cancer.Il est le résultat de l'effort collectif de cliniciens et chercheurs, au service de tous, y compris enseignants et étudiants.Objectifs : L'Atlas participe au projet génome et aux recherches en épidémiologie des cancers.L'Atlas est au carrefour de la recherche, de l'enseignement universitaire et post-universitaire (université médicale virtuelle, formation médicale continue) et de la télémédecine (aide au diagnostic).Il contribue à la « meta-médecine », médiation entre le flux débordant d'informations apporté par la communauté scientifique d'une part, et le médecin praticien d'autre part.Il aide le cytogénéticien dans son diagnostic et le clinicien dans son choix thérapeutique.L'Atlas est en accès libre, gratuit, ce qui est crucial pour nos collègues du tiers monde.Spécificité de l'Atlas : L'Atlas combine différents savoir sur un seul site : gènes et leur fonction, biologie cellulaire, maladies et implications cliniques, cytogénétique, bien sûr, mais aussi génétique clinique, avec les maladies héréditaires à risque accru de cancer.Cela unifie en un même concept les différents aspects de la génétique des cancers, ailleurs dispersés entre divers sites.L'iconographie aussi est diverse diverse (imagerie médicale, ana-path, chromosomes, structure 3-D des protéines, cartographie génétique...) et abondante (plus de 1 800 images).C'est enfin le seul site de génétique où le pronostic est donné !Résultats attendus : En un an, l'Atlas a accepté et publié plus de 230 articles.L'Atlas atteint maintenant 30 000 pages, écrites par 1 100 authors... et we need more authors !Nous développons maintenant une version'electronique' comprenant 60 volumes, de 1997 à fin 2009, comportant environ 1 800 articles, soit 9 500 pages pdf.Devenir un véritable journal international indexé dans PubMed sera une étape majeure dans le développement de l'Atlas.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.002
metaresearch head score (Gemma)0.014
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesInsufficient payload (model declined to judge)
Consensus categoriesInsufficient payload (model declined to judge)
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Not applicable · Consensus signal: Not applicable
GenreCandidate signal: Other · Consensus signal: Other
Teacher disagreement score0.216
Threshold uncertainty score0.308

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0020.014
Meta-epidemiology (narrow)0.0010.001
Meta-epidemiology (broad)0.0010.001
Bibliometrics0.0030.002
Science and technology studies0.0020.001
Scholarly communication0.0060.005
Open science0.0020.004
Research integrity0.0030.003
Insufficient payload (model declined to judge)0.7840.515

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.116
GPT teacher head0.480
Teacher spread0.363 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; the direct Gemma label and the distilled Codex classifier agree on what is shown here.

Study designNot applicable
Domainnot available
GenreOther

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

Quick stats

Citations0
Published2010
Admission routes1
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