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Enregistrement W4255851860 · doi:10.1038/labinvest.2016.166

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2017· article· en· W4255851860 sur OpenAlexaff
Zhang Zhang, Huijiao Chen, Min Chen, Xin He, Yiying Wang, Hongying Zhang, Daniela Allende, Deborah J. Chute, Michael Bonert, Mitchell S. Wachtel, Jens Schittenhelm, Martin Bonert, Winnie Luong, Seshadri Thirumala

Notice bibliographique

RevueLaboratory Investigation · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSarcoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensMcMaster UniversityUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Dermatofibrosarcoma protuberans (DFSP) is a dermal and subcutaneous intermediate tumour.Compared to other techniques, biopsy is not only a rapid outpatient procedure but also the optimal choice for unresectable patients with cutaneous tumor before neoadjuvant therapy.In DFSP, the rarity of tumours, atypical clinical manifestation and uncommon histological features may cause diagnosis pitfalls in the limited biopsy samples.The most remarkable cytogenetic characteristic of DFSP is the formation of the COL1A1-PDGFB fusion gene.The aim of this study was to analyse the clinical application value of fluorescence in situ hybridization (FISH) in biopsy of DFSP.Design: Twenty-three consecutive biopsy specimens of DFSP, collected from 2007 to 2014, were reviewed for clinicopathological features and immunohistochemical staining results, and detected with the COL1A1/PDGFB Fusion Probe and the PDGFB Break Apart Probe using FISH analysis.Controls included 5 fibromatosis and dermatofibromas.The positive criteria for COL1A1-PDGFB gene fusion and PDGFB rearrangement were both 10% and more of the cells showed meaningful signals.Results: The 23 tumour samples consisted of 10 punch biopsies and 13 shave biopsies (11 males and 12 females; mean age at diagnosis, 37 y; range, 14 to 75 y).Eighteen conventional DFSP, 1 Bednar tumour, 2 myxoid DFSP and 2 DFSP with fibrosarcomatous areas were included in the group.CD34 expression was strong and extensive in the spindle cell component in 19 cases (83%) of DFSP, including FS-DFSP, whereas one case of a conventional subtype was negative for CD34;One case of a conventional subtype and 2 myxoid subtypes had patchy CD34 expression.SMA was focal positive staining in 3 cases (13%).All cases were negative for desmin, S-100 protein, myogenin, Bcl-2, CD99, p16, p63, cytokeratin and EMA.In FISH detection, 21/23 cases (91%) were both positive for the COL1A1-PDGFB fusion signal and the PDGFB break apart signal.The percentage of COL1A1-PDGFB fusion gene was above 70% in 20/21 (95.2%) of DFSP.A PDGFB split signal pattern was observed in approximately 20%-80% of the interphase tumour nuclei.Conclusions: This is one of the few study to demonstrate the great value of detecting COL1A1-PDGFB fusion translocation by both the Fusion Probe and the Break Apart Probe in biopsies of DFSP using FISH analysis.As a molecular cytogenetic technique, FISH could become a standard procedure to confirm unusual clinical presentation and validate complicated and suspected diagnosis in the routine biopsy of DFSP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: Autre
Score de désaccord entre enseignants0,849
Score d'incertitude au seuil0,000

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0040,002
Science ouverte0,0010,003
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,8490,672

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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