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Enregistrement W4256116304 · doi:10.21203/rs.3.rs-398836/v1

GSTM1 and GSTT1 Double Null Genotypes Determining Cell Fate and Proliferation as Potential Risk Factors of Relapse in Children with Hematological Malignancies after Stem Cell Transplantation.

2021· preprint· en· W4256116304 sur OpenAlexaff
Simona Jurković Mlakar, Chakradhara Rao Uppugunduri Satyanarayana, Tiago Nava, Vid Mlakar, Hadrien G. Golay, Shannon Robin, Nicolas Waespe, Mohamed-Ali Rezgui, Yves Chalandon, Jaap Jan Boelens, Robbert G.M Bredius, Jean‐Hugues Dalle, Christina Peters, Selim Corbacioglu, Henrique Bittencourt, Maja Krajinović, Marc Ansari

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlutathione Transferases and Polymorphisms
Établissements canadiensCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTransplantationNull alleleGenotypeBiologyGlutathioneNull cellProgrammed cell deathOncologyCancer researchImmunologyInternal medicineAlleleMedicineGeneticsGeneApoptosisEnzymeBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<title>Abstract</title> <bold>Background</bold>: Relapse is the major cause of treatment failure in children with hematological malignancies (HMs) undergoing busulfan (BU)- based allogeneic hematopoietic stem cell transplantation (HSCT). Glutathione S-transferases (GSTs) isoforms that participate in BU detoxification and protect cells against stress and cell death may be linked to post-HSCT outcomes. This study aimed to retrospectively evaluate the genetic association of <italic>null</italic> variants of Glutathione S-transferases <italic>GSTM1 </italic>and <italic>GSTT1</italic> with relapse incidence in children with HMs undergoing BU- containing allogeneic HSCT and to assess the impact of these variants on BU-induced cytotoxicity on the immortalized and tumor lymphoblastoid cell lines (LCLs).<bold>Methods</bold>: <italic>GSTM1- and GSTT1- null</italic> alleles were genotyped using germline DNA from whole blood prior to a conditioning BU-based regimen. Association of <italic>GSTM1-</italic> and <italic>GSTT1- null</italic> variants with relapse incidence was analyzed using multivariable competing risk analysis. BU-induced cell-death studies were conducted in <italic>GSTs</italic>- <italic>null</italic> and <italic>non-null</italic> LCLs and CRISPR-Cas9 gene-edited THP1 leukemia cell lines. <bold>Results</bold>: <italic>Carrying GSTM1/GSTT1 double null genotype was found to be an</italic> independent risk factor for post-HSCT relapse in 86 children (adjusted HR: 6.52 [95% Cl, 2.76 - 15.42; p= 1.9 x 10<sup>-5</sup>]). BU induced cell death preferentially in THP1<sup><italic>GSTM1(non-null)</italic></sup> and LCLs<sup><italic>GSTM1(non-null)</italic></sup> as shown by decreased viability, increased necrosis and levels of the oxidized form of glutathione compared to <italic>null</italic> cells, while <italic>GSTT1</italic> <italic>non-null</italic> cells showed increased baseline proliferation. <bold>Conclusion</bold>: The clinical association suggests that <italic>GSTM1</italic>/<italic>GSTT1 double null genotype </italic>could serve as genetic stratification biomarker for the high risk of post-HSCT relapse. Functional studies have indicated that <italic>GSTM1</italic> status modulates BU-induced cell death. On the other hand, GSTT1 is proposed to be involved in baseline cell proliferation. <bold>Trial registration</bold>: ClinicalTrials.gov identifier: NCT01257854, Registered February 2008 – retrospectively registered.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,584
Score d'incertitude au seuil0,783

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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