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Enregistrement W4280521200 · doi:10.1101/2022.04.19.22273994

<i>SLCO5A1</i> and synaptic assembly genes contribute to impulsivity in juvenile myoclonic epilepsy

2022· preprint· en· W4280521200 sur OpenAlexafffund
Naim Panjwani, Amy Shakeshaft, Delnaz Roshandel, Lin Fan, Amber Collingwood, Anna Hall, Katherine Keenan, Celine Deneubourg, Filippo Mirabella, Simon Topp, Jana Zárubová, Rhys H. Thomas, Inga Talvik, Marte Syvertsen, Pasquale Striano, Anna Smith, Kaja Kristine Selmer, Guido Rubboli, Alessandro Orsini, Ching Ching Ng, Rikke S. Møller, Kheng Seang Lim, Khalid Hamandi, David A. Greenberg, Joanna Gesche, Elena Gardella, Choong Yi Fong, Christoph P. Beier, Danielle M. Andrade, Heinz Jungbluth, Mark P. Richardson, Annalisa Pastore, Manolis Fanto, Deb K. Pal, Lisa J. Strug

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensSickKids FoundationKrembil FoundationUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesEngineering and Physical Sciences Research CouncilMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchHorizon 2020 Framework ProgrammeSheffield Children's NHS Foundation TrustNorges ForskningsrådSt George's University Hospitals NHS Foundation TrustOdense UniversitetshospitalNewcastle upon Tyne Hospitals NHS Foundation TrustEisaiMinistero dell’Istruzione, dell’Università e della RicercaAction Medical ResearchEuropean CommissionSheffield Teaching Hospitals NHS Foundation TrustUniversity of NottinghamNational Institute for Health and Care ResearchNottingham University Hospitals NHS TrustHealth and Care Research WalesRoyal Free London NHS Foundation TrustGW PharmaceuticalsMedical Research Council Centre for Neurodevelopmental DisordersEpilepsy Research UKNationwide Children's HospitalKing's College LondonParc Geneteg CymruSyddansk UniversitetKing's College Hospital NHS Foundation Trust
Mots-clésImpulsivityJuvenile myoclonic epilepsyEpileptogenesisEpilepsyPsychologyNeuroscienceBiologyGeneticsPsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introductory Paragraph Elevated impulsivity is a key component of attention-deficit hyperactivity disorder (ADHD), bipolar disorder and epilepsy 1-5 . We performed a genome-wide association, colocalization and pathway analysis of impulsivity in juvenile myoclonic epilepsy (JME). We identify genome-wide associated SNPs at 8q13.3 (p=7.5 × 10 −9 ) and 10p11.21 (p=3.6 × 10 −8 ). The 8q13.3 locus colocalizes with SLCO5A1 expression quantitative trait loci in cerebral cortex (p=9.5 × 10 −3 ). SLCO5A1 codes for a membrane-bound organic anion transporter 6 and upregulates synapse assembly/organisation genes 7 . Pathway analysis also demonstrates 9.3-fold enrichment for synaptic assembly genes (p=0.03) including NRXN1, NLGN1 and PTPRD . RNAi knockdown of Oatp30B , the Drosophila homolog of SLCO5A1 , causes both over-reactive startling behaviour (p=8.7 × 10 −3 ) and increased seizure-like events (p=6.8 × 10 −7 ). Polygenic risk score for ADHD correlates with impulsivity scores (p=1.60 × 10 −3 ), demonstrating shared genetic contributions. SLCO5A1 loss-of-function represents a novel impulsivity and seizure mechanism. Synaptic assembly genes may inform the aetiology of impulsivity in health and disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,065

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0200,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission2
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