MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4280542612 · doi:10.3390/biomedicines10051110

Inhaled Corticosteroids Selectively Alter the Microbiome and Host Transcriptome in the Small Airways of Patients with Chronic Obstructive Pulmonary Disease

2022· article· en· W4280542612 sur OpenAlexafffundabout
William Yip, Xuan Li, Graeme J. Koelwyn, Stephen Milne, Fernando Sergio Leitão Filho, Chen Yang, Ana I. Hernández Cordero, Julia Yang, Cheng Wei Tony Yang, Tawimas Shaipanich, Stephan F. van Eeden, Janice M. Leung, Stephen Lam, Kelly M. McNagny, Don D. Sin

Notice bibliographique

RevueBiomedicines · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensBC Cancer AgencySimon Fraser UniversitySt. Paul's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesBritish Columbia Lung Association
Mots-clésFormoterolCOPDSalmeterolFluticasoneMicrobiomeMedicineBudesonideInternal medicineImmunologyBiologyAsthmaBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Patients with chronic obstructive pulmonary disease (COPD) are commonly treated with inhaled corticosteroid/long-acting ß2-agonist combination therapy. While previous studies have investigated the host-microbiome interactions in COPD, the effects of specific steroid formulations on this complex cross-talk remain obscure. METHODS: We collected and evaluated data from the Study to Investigate the Differential Effects of Inhaled Symbicort and Advair on Lung Microbiota (DISARM), a randomized controlled trial. Bronchoscopy was performed on COPD patients before and after treatment with salmeterol/fluticasone, formoterol/budesonide or formoterol-only. Bronchial brush samples were processed for microbial 16S rRNA gene sequencing and host mRNA sequencing. Longitudinal changes in the microbiome at a community, phylum and genus level were correlated with changes in host gene expression using a Spearman's rank correlation test. FINDINGS: . Gene enrichment analyses revealed the enrichment of pathways and biological processes related to innate and adaptive immunity and inflammation. None of these changes were evident in patients treated with formoterol/budesonide or formoterol alone. INTERPRETATION: Changes in the microbiome following salmeterol/fluticasone treatment are related to alterations in the host transcriptome in the small airways of patients with COPD. These data may provide insights into why some COPD patients treated with inhaled corticosteroids may be at an increased risk for airway infection, including pneumonia. FUNDING: The Canadian Institute of Health Research, the British Columbia Lung Association, and an investigator-initiated grant from AstraZeneca.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,862
Score d'incertitude au seuil0,306

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2022
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBiomedicinesMême sujetGut microbiota and healthTravaux en français237 207