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Enregistrement W4280584397 · doi:10.1126/science.abm6380

Human OTULIN haploinsufficiency impairs cell-intrinsic immunity to staphylococcal α-toxin

2022· article· en· W4280584397 sur OpenAlexfundno aff
András N. Spaan, Anna‐Lena Neehus, Emmanuel Laplantine, Frederik Staels, Masato Ogishi, Yoann Seeleuthner, Franck Rapaport, Keenan A. Lacey, Maya Chrabieh, David Hum, Mélanie Migaud, Araksya Izmiryan, Lazaro Lorenzo, Tatiana Kochetkov, Dani A. C. Heesterbeek, Bart W. Bardoel, Ashley Dumont, Kerry Dobbs, Solenne Chardonnet, Søren Heissel, Timour Baslan, Peng Zhang, Rui Yang, Dusan Bogunovic, Herman F. Wunderink, Pieter‐Jan Haas, Henrik Molina, Griet Van Buggenhout, Stanislas Lyonnet, Luigi D. Notarangelo, Mikko Seppänen, Robert Weil, Gisela Seminario, Héctor Gomez-Tello, Carine Wouters, Mehrnaz Mesdaghi, Mohammad Shahrooei, Xavier Bossuyt, Erdal Sağ, Rezan Topaloğlu, Seza Özen, Helen L. Leavis, Maarten M. J. van Eijk, Liliana Bezrodnik, Lizbeth Blancas‐Galicia, Alain Hovnanian, Aude Nassif, Brigitte Bader‐Meunier, Bénédicte Neven, Isabelle Meyts, Rik Schrijvers, Anne Puel, Jacinta Bustamante, Ivona Aksentijevich, Daniel L. Kastner, Victor J. Torres, Stéphanie Humblet‐Baron, Adrian Liston, Laurent Abel, Bertrand Boisson, Jean‐Laurent Casanova

Notice bibliographique

RevueScience · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJanssen BiotechNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthHonjo International Scholarship FoundationEuropean Molecular Biology OrganizationFondation pour la Recherche MédicaleMemorial Sloan-Kettering Cancer CenterInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleEuropean CommissionYork UniversityLastentautien TutkimussäätiöInstitut des maladies génétiques ImagineCystic Fibrosis FoundationKU LeuvenSt. Giles FoundationNational Center for Advancing Translational SciencesFondation Bettencourt SchuellerNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekAgence Nationale de la RechercheNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésHaploinsufficiencyBiologyImmunologyStaphylococcus aureusTumor necrosis factor alphaToxinMicrobiologyGeneGeneticsPhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The molecular basis of interindividual clinical variability upon infection with Staphylococcus aureus is unclear. We describe patients with haploinsufficiency for the linear deubiquitinase OTULIN, encoded by a gene on chromosome 5p. Patients suffer from episodes of life-threatening necrosis, typically triggered by S. aureus infection. The disorder is phenocopied in patients with the 5p− (Cri-du-Chat) chromosomal deletion syndrome. OTULIN haploinsufficiency causes an accumulation of linear ubiquitin in dermal fibroblasts, but tumor necrosis factor receptor–mediated nuclear factor κB signaling remains intact. Blood leukocyte subsets are unaffected. The OTULIN-dependent accumulation of caveolin-1 in dermal fibroblasts, but not leukocytes, facilitates the cytotoxic damage inflicted by the staphylococcal virulence factor α-toxin. Naturally elicited antibodies against α-toxin contribute to incomplete clinical penetrance. Human OTULIN haploinsufficiency underlies life-threatening staphylococcal disease by disrupting cell-intrinsic immunity to α-toxin in nonleukocytic cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations69
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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