Second-generation transfer mediates efficient propagation of ICE <i>Bs1</i> in biofilms
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Horizontal gene transfer (HGT) by integrative and conjugative elements (ICEs) is an important mechanism in the spread of antibiotic resistance genes. However, little is known about the spatiotemporal dynamic of ICEs propagation in bacterial biofilms, which are multicellular structures ubiquitous in the natural and clinical environment. Using a fluorescently marked ICE Bs1 , we report here that its propagation in biofilms is favored in recipient cells expressing the biofilm matrix. Also, conjugation appears restricted to clusters of bacteria in a close neighborhood in which a high level of ICE Bs1 transfer occurs. These conjugative clusters are heterogenously distributed in the biofilm, forming close to the air-biofilm interface. Importantly, we established that transconjugant cells are the main contributors to ICE Bs1 propagation in biofilms. Our findings provide a novel spatiotemporal understanding of ICEs propagation in biofilms, which should have an important role in our understanding of horizontal gene transfer in relevant settings. Importance The transfer of mobile genetic elements between bacteria is the main cause of the spread of antibiotic resistance genes. While biofilms are the predominant bacterial lifestyle both in the environment and in clinical settings, their impact on the propagation of mobile genetic elements is still poorly understood. In this study, we examined the spatiotemporal propagation of the well-characterized integrative and conjugative element (ICE) ICE Bs1 . Using the Gram-positive B. subtilis , we observed that the main actors of ICE Bs1 propagation in biofilms are the newly formed transconjugants that allow rapid transfer of ICE Bs1 to new recipients. Our study provides a better understanding of the spatiotemporal dynamic of conjugative transfer in biofilms.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».