Postmortem gene expression profiles in the habenulae of suicides: implication of endothelial dysfunction in the neurovascular system
Notice bibliographique
Résumé
The habenula (Hb) is an epithalamic structure that links multiple forebrain areas with the mid/hindbrain monoaminergic systems. As an anti-reward center, it has been implicated in the etiology of various neuropsychiatric disorders, particularly those associated with dysregulated reward circuitry. In this regard, Hb has been proposed as a therapeutic target for treatment-resistant depression associated with a higher risk of suicide. Therefore, we aimed to gain insight into the molecular signatures of the Hb in association with suicide in individuals with major depression. Postmortem gene expression analysis identified 251 differentially expressed genes (DEGs) in the Hb tissue of suicides in comparison with Hb tissues from neurotypical individuals. Subsequent bioinformatic analyses using single-cell transcriptome data from the mouse Hb showed that the levels of a subset of endothelial cell-enriched genes encoding cell-cell junctional complex and plasma membrane-associated proteins, as well as the levels of their putative upstream transcriptional regulators, were significantly affected in suicides. Although our findings are based on a limited number of samples, the present study suggests a potential association of endothelial dysfunction in the Hb with depression and suicidal behavior.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».