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Enregistrement W4281572412 · doi:10.1038/s42003-022-03453-2

The Pel polysaccharide is predominantly composed of a dimeric repeat of α-1,4 linked galactosamine and N-acetylgalactosamine

2022· article· en· W4281572412 sur OpenAlexafffund
François Le Mauff, Erum Razvi, Courtney Reichhardt, Piyanka Sivarajah, Matthew R. Parsek, P. Lynne Howell, Donald C. Sheppard

Notice bibliographique

RevueCommunications Biology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensSickKids FoundationUniversity of TorontoMcGill UniversityHospital for Sick ChildrenInstitute of Infection and ImmunityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesCIHR Skin Research Training CentreNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Glycomics NetworkU.S. Department of Health and Human ServicesGovernment of CanadaNational Institutes of HealthCanadian Institutes of Health ResearchMcGill University Health CentreMcGill University
Mots-clésGalactosaminePolysaccharideHydrolysisChemistryStrain (injury)BiofilmBacteriaGlycoside hydrolaseBiochemistryPseudomonas aeruginosaMicrobiologyAcetylationBiologyGeneGalactoseGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The genetic capacity to synthesize the biofilm matrix exopolysaccharide Pel is widespread among Gram-negative and Gram-positive bacteria. However, its exact chemical structure has been challenging to determine. Using a Pseudomonas aeruginosa strain engineered to overproduce Pel, improvements to the isolation procedure, and selective hydrolysis with the glycoside hydrolase PelA h , we demonstrate that Pel is a partially de- N- acetylated linear polymer of α-1,4- N- acetylgalactosamine comprised predominantly of dimeric repeats of galactosamine and N- acetylgalactosamine.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,264
Score d'incertitude au seuil0,359

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations65
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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