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Enregistrement W4281622207 · doi:10.1080/03235408.2022.2081653

Genetic structure and phylogenetic relationships of <i>Leptosphaeria maculans</i> and <i>L. biglobosa</i> in Northern regions of Iran

2022· article· en· W4281622207 sur OpenAlexaff
Ali Zamanmirabadi, Roghayeh Hemmati, Aria Dolatabadian, Jacqueline Batley

Notice bibliographique

RevueArchives of Phytopathology and Plant Protection · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueEssential Oils and Antimicrobial Activity
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLeptosphaeria maculansBiologyPhylogenetic treeBlacklegGenetic diversityBotanyCanolaBrassicaGeneGeneticsPopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Blackleg, caused by Leptosphaeria maculans, and L. biglobosa, is a major disease that hinders canola (Brassica napus) production worldwide. In this study, 51 Leptosphaeria isolates, and previously deposited sequences were examined for genetic diversity using ITS, β-tubulin, tef and act gene regions. Phylogenetic analyses showed that the isolates fell within two sub-species of brassicae and canadensis. Out of 51 Iranian isolates, 55%, 37%, and 8% were found as L. biglobosa canadensis, L. biglobosa brassicae, and L. maculans, respectively. Accordingly, the canadensis sub-species was found to be the predominant sub-species in Iran. There was no difference between Iranian and foreign brassicae sub-species in terms of ITS nucleotide sequences. This paper confirms the presence of brassicae and canadensis sub-species in Iran and describes the distribution of L. biglobosa in the country. Moreover, Leptosphaeria species were distinguished using a phylogenetic tree based on the tef region.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,715
Score d'incertitude au seuil0,139

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,178
Écart entre enseignants0,163 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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