Discovery of Rift Valley fever virus natural pan-inhibitors by targeting its multiple key proteins through computational approaches
Notice bibliographique
Résumé
The Rift Valley fever virus (RVFV) is a zoonotic arbovirus and pathogenic to both humans and animals. Currently, no proven effective RVFV drugs or licensed vaccine are available for human or animal use. Hence, there is an urgent need to develop effective treatment options to control this viral infection. RVFV glycoprotein N (GN), glycoprotein C (GC), and nucleocapsid (N) proteins are attractive antiviral drug targets due to their critical roles in RVFV replication. In present study, an integrated docking-based virtual screening of more than 6000 phytochemicals with known antiviral activities against these conserved RVFV proteins was conducted. The top five hit compounds, calyxin C, calyxin D, calyxin J, gericudranins A, and blepharocalyxin C displayed optimal binding against all three target proteins. Moreover, multiple parameters from the molecular dynamics (MD) simulations and MM/GBSA analysis confirmed the stability of protein-ligand complexes and revealed that these compounds may act as potential pan-inhibitors of RVFV replication. Our computational analyses may contribute toward the development of promising effective drugs against RVFV infection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».