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Enregistrement W4281754242 · doi:10.1093/cvr/cvac066.072

A preliminary study of patient-specific differences in induced pluripotent stem cell-derived cardiomyocytes following hypoxia-induced injury

2022· article· en· W4281754242 sur OpenAlexaff
Ida Derish, J Zwaig, Kashif Khan, David Derish, J To, P Young, Renzo Cecere

Notice bibliographique

RevueCardiovascular Research · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePluripotent Stem Cells Research
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInduced pluripotent stem cellMedicinePopulationHomeobox protein NANOGHypoxia (environmental)CardiomyopathyStem cellBioinformaticsInternal medicineCardiologyHeart failureBiologyEmbryonic stem cellCell biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Funding Acknowledgements Type of funding sources: Foundation. Main funding source(s): Courtois Cardiovascular Signature Program The increasing rate of cardiovascular disease (CVD) contributes to a worsening morbidity in the general population and a socioeconomic burden on the healthcare system. Newly approved therapies present unforeseen side effects and occasionally entail adverse cardiovascular responses in patients - this issue significantly stalls efficacious pharmacological development. Indeed, modern cardiovascular treatments do not account for the variability of individual patient reactions, due to a lack of a representative in vitro cardiac model. While the use of induced pluripotent stem cell-derived cardiomyocytes (iPSC-CMs) has gained traction as a superior model for drug screening when compared to cardiac biopsies and immortalized cell lines, cardiovascular patient-specific differences remain poorly understood and understudied. We hypothesized that 1) cardiomyopathic patient-derived iPSC-CMs have differing baselines of beating rate, contractility, viability, metabolic activity and protein expression, when compared to healthy controls, and that 2) cell lines have patient-specific responses to hypoxia-induced injury. As such, the purpose of this preliminary study was two-fold: 1) to perform a characterization of patient iPSC-CM function, and 2) to study patient-specific cellular responses to hypoxia. First, we generated iPSC-CMs from the peripheral blood of donors (n=6 patients with cardiomyopathies, n=2 healthy donors). We then confirmed the expression of prominent cardiac markers connexin 43 (CXN43), sarcoendoplasmic reticulum Ca2+ ATPase (SERCA2a), GATA4 and cardiac Troponin T, as well as a lack of pluripotency markers Octamer-binding transcription factor 4 (OCT4), Nanog, Stage-specific embryonic antigen-4 (SSEA-4) and TRA-1-60 in the iPSC-CM lines, via immunocytochemistry. Preliminary assessment of iPSC-CMs (days 1-30 post-differentiation) revealed significant baseline differences in beating rate (p<0.01) and contractility amplitude (p<0.01) between iPSC-CMs derived from cardiomyopathic patients and healthy donors. We then subjected iPSC-CM lines to hypoxic conditions (24 hours), to mimic ischaemic injury. Diseased patient-derived lines had significantly decreased viability and metabolic activity when compared to the controls, under normoxic (p<0.01) and hypoxic conditions (p<0.001). Immunoblotting revealed differential expression of cardiac markers and factors implicated in cardiac function, cardioprotection and pathology. Taken together, these results suggest that the detected differences at the cellular level after hypoxia-induced injury might be translatable to the inter-individual variability currently observed in the CVD patient population. The data gathered will prove to be instrumental in future studies of iPSC-CM responses to treatment. With this preliminary study, we hope to shift the focus towards these patient-specific differences at the cellular level, in the search for tailored therapies and a higher standard of care for CVD patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,113
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,003
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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