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Enregistrement W4281759725 · doi:10.1002/ecy.3780

Putting the Mantel test back together again

2022· article· en· W4281759725 sur OpenAlexafffund
Keith M. Somers, Donald A. Jackson

Notice bibliographique

RevueEcology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEcology and Vegetation Dynamics Studies
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésMantel testBivariate analysisMathematicsEuclidean distanceStatisticsType I and type II errorsTest (biology)Null hypothesisDemographyEcologyPopulationBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The Mantel test has been widely used in ecology and evolution, but over the last two decades it has been frequently critiqued because results were inconsistent with expectations and there were issues with Type I (false‐positive) and Type II (false‐negative) error rates. Three‐matrix extensions of the Mantel test have been challenged for similar reasons. Even the null hypotheses underlying the Mantel test have been questioned. As a result, use of the Mantel test and its variants has been discouraged or limited to special situations. Here, we examine Mantel test criticisms including the lack of agreement between traditional variable‐based Pearson correlations ( r ) and observation‐based Mantel correlations ( r m ), and the unusual Type I and Type II error rates. We propose an alternate proximity measure that resolves these issues. We use simulations and examples to contrast Mantel results based on Euclidean distance, squared Euclidean distance, and the simple difference ( Diff ) with traditional bivariate Pearson correlations. We demonstrate that use of the simple difference in Mantel tests can resolve the underlying problems with poor agreement between bivariate Pearson and Mantel correlations, as well as appropriate Type I and Type II errors (i.e., where r = cor( x,y ) and r m = cor(d x , d y ), if d x = Diff ( x ) and d y = Diff ( y ), r = r m ). We also show that the simple difference can provide solutions to issues with partial Mantel tests and distance‐based MANOVA. Because our results resolve many of the issues with Mantel tests, we hope that these findings will restore the popularity of the Mantel test.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,103
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0220,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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